🎨 Format of the words.md

This commit is contained in:
Maxim Lebedev 2020-06-19 12:45:13 +05:00
parent 24ffc678f7
commit 1b1e045ea7
No known key found for this signature in database
GPG Key ID: F8978F46FF0FFA4F
4 changed files with 125 additions and 99 deletions

View File

@ -209,6 +209,7 @@
<p>...могли бы быть хуже. Вот параллельная вселенная, которой мы избежали:</p>
<h3>Сценарий 0: Не делать ничего</h3>
<p>Около 1 из 20 людей заражённых COVID-19 нуждаются в реанимации.<a href="#fn13" class="footnote-ref" id="fnref13" role="doc-noteref"><sup>13</sup></a> В богатых странах вроде США одна кровать в реанимационном отделении приходится на 3400 людей.<a href="#fn14" class="footnote-ref" id="fnref14" role="doc-noteref"><sup>14</sup></a> Следовательно, США могут выдержать 20 больных на 3400 людей <em>одновременно</em> — другими словами около 0,6% населения.</p>
<p>От 4,9% до 11,5% <em>всех</em> случаев COVID-19 нуждались в реанимации. Оптимистично возьмём нижнюю оценку и получим 5% или 1 из 20. Отметим, что это число основано на возрастной пирамиде США, и будет выше в странах со старым населением и ниже в странах с молодым населением.</p>
<p>Даже если мы <em>более чем утроим</em> это число и примем его за 2%, вот что могло бы случиться, <em>если бы мы ничего не делали:</em></p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-1&format=lines" width="800" height="540"></iframe>
@ -221,8 +222,9 @@
<p>План "Сгладить кривую" (Flatten the curve) рекламируют все организации здравоохранения, а брттанский план "Коллективного иммунитета" (herd immunity) все ругали. Это был <em>один и тот же план.</em> Великобритания просто плохо его объяснила.<a href="#fn15" class="footnote-ref" id="fnref15" role="doc-noteref"><sup>15</sup></a></p>
<p>Тем не менее, оба плана содержат буквально фатальный недостаток.</p>
<p>Давайте вначале посмотрим на два главных способа "сгладить кривую": мытьё рук и соблюдение дистанции.</p>
<p>Частое мытьё рук снижает гриппы и простуды на ~25%[^handwashing], а введение жёсткого карантина в Лондоне сократило количество близких контактов на 70%[^london]. Давайте предположим, что мытьё рук уменьшает R на 25% <em>или меньше</em>, а дистанцирование на 70% <em>или меньше</em>: [^handwashing]: "Все 8 доступных исследований сообщают, что мытьё рук снижает риск респираторных инфекций, но оценивают уменьшение риска по-разному, от 6 до 44%. Усреднённое значение составляет 24%, 90-процентный доверительный интервал — 6-40%." (All eight eligible studies reported that handwashing lowered risks of respiratory infection, with risk reductions ranging from 6% to 44% [pooled value 24% (95% CI 640%)].) Мы округлили усреднённое значение до 25% для простоты. <a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-3156.2006.01568.x">Rabie, T. и Curtis, V.</a> Обратите внимание, в этом метаанализе указывают на ужасное качество исследований мытья рук. [^london]: "Мы обнаружили уменьшение в среднем числе контактов на человека в 73%. Этого должно быть достаточно для уменьшения R<sub>0</sub> со значения 2,6 до карантина до 0,62 (0,37 — 0,89)." (We found a 73% reduction in the average daily number of contacts observed per participant. This would be sufficient to reduce R0 from a value from 2,6 before the lockdown to 0,62 (0,37 - 0,89) during the lockdown.) Для простоты мы округлили это число до 70%. <a href="https://cmmid.github.io/topics/covid19/comix-impact-of-physical-distance-measures-on-transmission-in-the-UK.html">Jarvis and Zandvoort et al</a></p>
<p><strong>Поиграйте с этим калькулятором, чтобы увидеть как % не-<icon s></icon>, мытьё рук и дистанцирование уменьшают R:</strong> (этот калькулятор визуализирует <em>относительные</em> эффекты, поэтому кажется, что увеличение некоторых эффектов выглядит как уменьшение других).<a href="#fn16" class="footnote-ref" id="fnref16" role="doc-noteref"><sup>16</sup></a>)</p>
<p>Частое мытьё рук снижает гриппы и простуды на ~25%<a href="#fn16" class="footnote-ref" id="fnref16" role="doc-noteref"><sup>16</sup></a>, а введение жёсткого карантина в Лондоне сократило количество близких контактов на 70%<a href="#fn17" class="footnote-ref" id="fnref17" role="doc-noteref"><sup>17</sup></a>. Давайте предположим, что мытьё рук уменьшает R на 25% <em>или меньше</em>, а дистанцирование на 70% <em>или меньше</em>:</p>
<p>Мы округлили усреднённое значение до 25% для простоты. <a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-3156.2006.01568.x">Rabie, T. и Curtis, V.</a> Обратите внимание, в этом метаанализе указывают на ужасное качество исследований мытья рук.</p>
<p><strong>Поиграйте с этим калькулятором, чтобы увидеть как % не-<icon s></icon>, мытьё рук и дистанцирование уменьшают R:</strong> (этот калькулятор визуализирует <em>относительные</em> эффекты, поэтому кажется, что увеличение некоторых эффектов выглядит как уменьшение других).<a href="#fn18" class="footnote-ref" id="fnref18" role="doc-noteref"><sup>18</sup></a>)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-2a&format=calc" width="285" height="260"></iframe>
</div>
@ -249,14 +251,14 @@
<p><strong>Карантин — это не лечение. Это перезапуск.</strong></p>
<p>А что если мы будем вводить карантин снова и снова?</p>
<h3>Сценарий 3: Прерывистый карантин</h3>
<p>Это решение впервые предложено в отчете Имперского колледжа Лондона 16 марта, а потом в статье ученых из Гарварда.<a href="#fn17" class="footnote-ref" id="fnref17" role="doc-noteref"><sup>17</sup></a></p>
<p>Это решение впервые предложено в отчете Имперского колледжа Лондона 16 марта, а потом в статье ученых из Гарварда.<a href="#fn19" class="footnote-ref" id="fnref19" role="doc-noteref"><sup>19</sup></a></p>
<p><strong>Посмотрим на симуляцию:</strong> (После воспроизведения записанного сценария вы можете просимулировать <em>собственное</em> расписание карантина, двигая ползунки, пока идёт симуляция! Вы можете ставить симуляцию на паузу и менять её скорость.)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-4&format=lines" width="800" height="540"></iframe>
</div>
<p>Это <em>позволит</em> избежать переполнения реанимаций! И это <em>сильно лучше</em> чем 18-месячный карантин до изобретения вакцины. Нам надо просто... не выходить из дома несколько месяцев, потом жить как обычно несколько месяцев. Повторять, пока вакцина не будет готова. (И если вакцину не изобретут, повторять, пока мы не достигнем коллективного иммунитета... в 2022 году.)</p>
<p>Конечно здорово нарисовать линию "Вместимость отделений реанимации", но есть много важных вещей, которых мы <em>не можем</em> просимулировать здесь. Например:</p>
<p><strong>Психическое здоровье:</strong> Одиночество — это один из главных факторов риска развития депрессии, стресса и самоубийств. И оно влияет на раннюю смерть как 15 сигарет в день.<a href="#fn18" class="footnote-ref" id="fnref18" role="doc-noteref"><sup>18</sup></a></p>
<p><strong>Психическое здоровье:</strong> Одиночество — это один из главных факторов риска развития депрессии, стресса и самоубийств. И оно влияет на раннюю смерть как 15 сигарет в день.<a href="#fn20" class="footnote-ref" id="fnref20" role="doc-noteref"><sup>20</sup></a></p>
<p><strong>Финансовое состояние:</strong> "А как же экономика?!" — звучит будто вам деньги важнее жизней. Но "экономика" — это не просто акции: это про возможность людей давать жильё и еду тем, кого они любят, вкладывать в будущее своих детей, наслаждаться искусством, едой и видеоиграми — всем тем, что делает жизнь осмысленной. И кроме того, бедность <em>сама по себе</em> оказывает ужасное влияние на физическое и психическое здоровье.</p>
<p>Мы не говорим, что мы <em>не должны</em> самоизолироваться! Мы посмотрим на "периодический" карантин позже. Он всё ещё не идеален.</p>
<p>Но подождите... Разве Тайвань и Южная Корея <em>уже не победили</em> COVID-19? За 4 месяца и <em>без</em> длительного карантина?</p>
@ -264,14 +266,14 @@
<h3>Сценарий 4: Тестировать, отслеживать, изолировать</h3>
<p><em>"Конечно, мы *могли бы* сделать то, что Тайвань и Южная Корея сделали с самого начала, но уже слишком поздно. Мы упустили начало."</em></p>
<p>Но всё складывается! "Карантин — это не лечение. Это перезапуск."... <strong>А перезапуск нам и нужен!</strong></p>
<p>Чтобы понять как Тайвань и Южная Корея сдержали COVID-19, нам надо понять типичное развитие болезни<a href="#fn19" class="footnote-ref" id="fnref19" role="doc-noteref"><sup>19</sup></a>:</p>
<p>Чтобы понять как Тайвань и Южная Корея сдержали COVID-19, нам надо понять типичное развитие болезни<a href="#fn21" class="footnote-ref" id="fnref21" role="doc-noteref"><sup>21</sup></a>:</p>
<p><img src="pics/timeline1.png" /></p>
<p>Если больные приступают к самоизоляции только когда понимают, что больны (то есть, когда чувствуют симптомы), вирус всё ещё может распространяться:</p>
<p><img src="pics/timeline2.png" /></p>
<p>И на самом деле, 44% всех передач вируса именно что <em>пред</em>-симптоматические!<a href="#fn20" class="footnote-ref" id="fnref20" role="doc-noteref"><sup>20</sup></a></p>
<p>И на самом деле, 44% всех передач вируса именно что <em>пред</em>-симптоматические!<a href="#fn22" class="footnote-ref" id="fnref22" role="doc-noteref"><sup>22</sup></a></p>
<p>Но если нам удаётся отследить <em>и поместить в карантин</em> людей, которые недавно контактировали с заболевшим... мы останавливаем распостранение, оказываясь на шаг впереди вируса!</p>
<p><img src="pics/timeline3.png" /></p>
<p>Это называется <strong>отслеживанием контактов</strong>. Это старая идея, нашедшая весьма масштабные применения во время вспышки Эболы<a href="#fn21" class="footnote-ref" id="fnref21" role="doc-noteref"><sup>21</sup></a>, и сейчас она является основным средством, с помощью которого Тайвань и Южная Корея сдерживают COVID-19! (Таким же образом в СССР за месяц сдержали вспышку оспы в Москве 1959—1960<a href="#fn22" class="footnote-ref" id="fnref22" role="doc-noteref"><sup>22</sup></a><em>прим. пер.</em>)</p>
<p>Это называется <strong>отслеживанием контактов</strong>. Это старая идея, нашедшая весьма масштабные применения во время вспышки Эболы<a href="#fn23" class="footnote-ref" id="fnref23" role="doc-noteref"><sup>23</sup></a>, и сейчас она является основным средством, с помощью которого Тайвань и Южная Корея сдерживают COVID-19! (Таким же образом в СССР за месяц сдержали вспышку оспы в Москве 1959—1960<a href="#fn24" class="footnote-ref" id="fnref24" role="doc-noteref"><sup>24</sup></a><em>прим. пер.</em>)</p>
<p>(Отслеживание также позволяет более эффективно расходовать ограниченное количество тестов, чтобы отследить предсимптоматических <icon i></icon>, не тестируя почти всё население.)</p>
<p>Изначально контакты отслеживались с помощью личных интервью, но <em>сами по себе</em> интервью недостаточно быстры для ~48-часового окна COVID-19. Именно поэтому отслеживателям контактов нужна помощь, и их можно дополнить — <em>не</em> заменить — отслеживающими приложениями.</p>
<p>Это не идея технарей, которым лишь бы разработать приложение: впервые использовать приложение для борьбы с COVID-19 предложила <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936">команда Оксфордских эпидемиологов</a>.</p>
@ -280,10 +282,10 @@
<p>Работает оно так:</p>
<p><img src="pics/dp3t.png" /></p>
<p>(<a href="https://ncase.me/contact-tracing/">полная версия комикса (на английском) здесь</a>)</p>
<p>Вместе с подобными командами вроде TCN Protocol<a href="#fn23" class="footnote-ref" id="fnref23" role="doc-noteref"><sup>23</sup></a> и MIT PACT<a href="#fn24" class="footnote-ref" id="fnref24" role="doc-noteref"><sup>24</sup></a>, они вдохновили Apple и Google встроить безопасное отслеживание контактов прямо в Androis/iOS.<a href="#fn25" class="footnote-ref" id="fnref25" role="doc-noteref"><sup>25</sup></a>. Вскоре ваше местное управление здравоохранения сможет попросить вас загрузить подобное приложение. Если это и впрямь будет безопасное приложение с открытым кодом, непременно сделайте это!</p>
<p>Вместе с подобными командами вроде TCN Protocol<a href="#fn25" class="footnote-ref" id="fnref25" role="doc-noteref"><sup>25</sup></a> и MIT PACT<a href="#fn26" class="footnote-ref" id="fnref26" role="doc-noteref"><sup>26</sup></a>, они вдохновили Apple и Google встроить безопасное отслеживание контактов прямо в Androis/iOS.<a href="#fn27" class="footnote-ref" id="fnref27" role="doc-noteref"><sup>27</sup></a>. Вскоре ваше местное управление здравоохранения сможет попросить вас загрузить подобное приложение. Если это и впрямь будет безопасное приложение с открытым кодом, непременно сделайте это!</p>
<p>А люди без смартфонов? А инфицированные дверные ручки? А "настоящие" асимптоматические случаи? Приложения, отслеживающие контакты, не могут поймать все передачи... <em>Но ничего страшного!</em> Нам не нужно ловить <em>все</em> передачи, хватит и 60+%, чтобы достичь R &lt; 1.</p>
<p>(Нытьё о путанице между предсимптоматическими и "настоящими" асимптоматическими. "Настоящие" асимптоматические случаи редки:<a href="#fn26" class="footnote-ref" id="fnref26" role="doc-noteref"><sup>26</sup></a>)</p>
<p>Изоляция <em>симптоматических</em> случаев может уменьшить R на 40%, а помещение в карантин их <em>предсимптоматичеких</em> контактёров может уменьшить R на 50%<a href="#fn27" class="footnote-ref" id="fnref27" role="doc-noteref"><sup>27</sup></a>:</p>
<p>(Нытьё о путанице между предсимптоматическими и "настоящими" асимптоматическими. "Настоящие" асимптоматические случаи редки:<a href="#fn28" class="footnote-ref" id="fnref28" role="doc-noteref"><sup>28</sup></a>)</p>
<p>Изоляция <em>симптоматических</em> случаев может уменьшить R на 40%, а помещение в карантин их <em>предсимптоматичеких</em> контактёров может уменьшить R на 50%<a href="#fn29" class="footnote-ref" id="fnref29" role="doc-noteref"><sup>29</sup></a>:</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-4a&format=calc" width="285" height="340"></iframe>
</div>
@ -313,23 +315,23 @@
<p>Не забывайте, что даже если мы не можем добиться R &lt; 1, уменьшение R всё равно уменьшает общее число случаев, спасая жизни. Но всё равно, R &lt; 1 — это идеал, так что вот ещё способы снизить R:</p>
<p><strong>Маски для всех</strong></p>
<p><em>"Стойте,"</em> — скажете вы: <em>"я думал, что маска не защитит меня от заражения?"</em></p>
<p>Действительно. Маски не защищают тебя от заражения<a href="#fn28" class="footnote-ref" id="fnref28" role="doc-noteref"><sup>28</sup></a>, они не дают тебе заражать <em>других</em>.</p>
<p>Действительно. Маски не защищают тебя от заражения<a href="#fn30" class="footnote-ref" id="fnref30" role="doc-noteref"><sup>30</sup></a>, они не дают тебе заражать <em>других</em>.</p>
<p><img src="pics/masks.png" /></p>
<p>Облекая в числа: хирургические маски <em>на больном человеке</em> уменьшают количество вирусов гриппа и простуды в аэрозоле на 70%.<a href="#fn29" class="footnote-ref" id="fnref29" role="doc-noteref"><sup>29</sup></a> Уменьшение передачи на 70% — это такой же эффект как от жёсткого карантина!</p>
<p>Однако мы не знаем наверняка эффект масок <em>именно</em> на COVID-19. В науке следует публиковать открытие, если ты в нём уверен на 95%. (Следует...<a href="#fn30" class="footnote-ref" id="fnref30" role="doc-noteref"><sup>30</sup></a>) Маски, по состоянию на май 2020, не проходят рубеж в 95%.</p>
<p>Облекая в числа: хирургические маски <em>на больном человеке</em> уменьшают количество вирусов гриппа и простуды в аэрозоле на 70%.<a href="#fn31" class="footnote-ref" id="fnref31" role="doc-noteref"><sup>31</sup></a> Уменьшение передачи на 70% — это такой же эффект как от жёсткого карантина!</p>
<p>Однако мы не знаем наверняка эффект масок <em>именно</em> на COVID-19. В науке следует публиковать открытие, если ты в нём уверен на 95%. (Следует...<a href="#fn32" class="footnote-ref" id="fnref32" role="doc-noteref"><sup>32</sup></a>) Маски, по состоянию на май 2020, не проходят рубеж в 95%.</p>
<p>Однако, пандемии — они как покер, <strong>Если ты делаешь ставки только когда на 95% уверен, то ты проиграешь.</strong> Как замечает недавняя статья про маски в Британском Медицинском Журнале, мы <em>вынуджены</em> проводить анализ стоимости и воздействия в условиях неопределённости. Например:</p>
<p>Стоимость: самодельные тканевые маски (достигающие ~2/3 эффективности относительно хирургических масок), очень дёшевы. Хирургические маски дороже, но они всё ещё дешёвые.</p>
<p>Воздействие: Даже если у нас шансы 50-50, что хирургические маски снижают интенсивность передачи вируса на 0 или 70 процентов, среднее "ожидание" всё ещё 35%, как у половины самоизоляции! Так что давайте, ткнув пальцем в небо, посчитаем, что хирургические маски понижают R на 35%, со скидкой на неопределённость. (Как обычно, можете взять свои числа, двигая ползунки вверх-вниз)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-6a&format=calc" width="285" height="380"></iframe>
</div>
<p>(прочие аругменты за и против масок: <a href="#fn31" class="footnote-ref" id="fnref31" role="doc-noteref"><sup>31</sup></a>)</p>
<p>(прочие аругменты за и против масок: <a href="#fn33" class="footnote-ref" id="fnref33" role="doc-noteref"><sup>33</sup></a>)</p>
<p><strong>"Их тяжело правильно носить."</strong> А ещё тяжело мыть руки, полностью придерживаясь рекомендаций ВОЗ — смотрите сами, "Шаг 3 (из 12): Правой ладонью растирать тыльную поверхность левой руки, переплетя пальцы, и наоборот." Но мы всё равно настоятельно рекомендуем мыть руки, потому что даже неидеальные меры лучше, чем ничего.</p>
<p><strong>Из-за этого люди станут менее серьёзно относиться к мытью рук и социальному дистанцированию</strong>. Само собой, так же, как люди в ремнях безопасности меньше обращают внимания на дорожные знаки, а после использования зубной нити готовы есть камни. На самом деле, мы утверждаем обратное: маски своим присутствием <em>вечно напоминают об осторожности</em>, а в Восточной Азии они стали символом солидарности!</p>
<p>Маски <em>сами по себе</em> не сделают R &lt; 1. Но если мытьё рук и "Тестировать, отслеживать, изолировать" дадут нам R = 1,10, то если к тому же каждый третий наденет маску, ситуация перевернётся за рубеж R &lt; 1, то есть вирус побеждён!</p>
<p><strong>Лето:</strong></p>
<p>Безусловно, это не то "вмешательство", на которое мы можем повлиять, но оно непременно поможет! Некоторые новостные издания сообщают, что COVID-19 лето нипочём. Они наполовину правы: из-за лета R не станет &lt; 1, но оно <em>точно</em> снизит R.</p>
<p>Для COVID-19, повышение температуры на 1°C понижает R на 1,2%.<a href="#fn32" class="footnote-ref" id="fnref32" role="doc-noteref"><sup>32</sup></a> Разница температур между зимой и летом в Нью-Йорке составляет 15°С, так что R должен снизиться на 18%. Для Москвы эти цифры составляют 26°C и 31% соответственно.</p>
<p>Для COVID-19, повышение температуры на 1°C понижает R на 1,2%.<a href="#fn34" class="footnote-ref" id="fnref34" role="doc-noteref"><sup>34</sup></a> Разница температур между зимой и летом в Нью-Йорке составляет 15°С, так что R должен снизиться на 18%. Для Москвы эти цифры составляют 26°C и 31% соответственно.</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-6b&format=calc" width="285" height="220"></iframe>
</div>
@ -369,10 +371,10 @@
<p>Вы подхватили COVID-19 и выздоровели. Или вам поставили прививку. В любом случае у вас иммунитет...</p>
<p>...<em>Надолго ли?</em></p>
<ul>
<li>COVID-19 является близким родственником SARS, который давал переболевшим 2 года иммунитета.<a href="#fn33" class="footnote-ref" id="fnref33" role="doc-noteref"><sup>33</sup></a></li>
<li>Коронавирусы, которые вызывают "обычную" простуду могут дать вплоть до 8 месяцев иммунитета.<a href="#fn34" class="footnote-ref" id="fnref34" role="doc-noteref"><sup>34</sup></a></li>
<li>Есть репортажи о людях, которые переболели COVID-19, а потом сновы получили положительный тест, но эти результаты могут оказаться ложноположительными.<a href="#fn35" class="footnote-ref" id="fnref35" role="doc-noteref"><sup>35</sup></a></li>
<li>Одно <em>неотрецензированное</em> исследование на обезьянах говорит о как минимум 28-дневном иммунитете к COVID-19.<a href="#fn36" class="footnote-ref" id="fnref36" role="doc-noteref"><sup>36</sup></a></li>
<li>COVID-19 является близким родственником SARS, который давал переболевшим 2 года иммунитета.<a href="#fn35" class="footnote-ref" id="fnref35" role="doc-noteref"><sup>35</sup></a></li>
<li>Коронавирусы, которые вызывают "обычную" простуду могут дать вплоть до 8 месяцев иммунитета.<a href="#fn36" class="footnote-ref" id="fnref36" role="doc-noteref"><sup>36</sup></a></li>
<li>Есть репортажи о людях, которые переболели COVID-19, а потом сновы получили положительный тест, но эти результаты могут оказаться ложноположительными.<a href="#fn37" class="footnote-ref" id="fnref37" role="doc-noteref"><sup>37</sup></a></li>
<li>Одно <em>неотрецензированное</em> исследование на обезьянах говорит о как минимум 28-дневном иммунитете к COVID-19.<a href="#fn38" class="footnote-ref" id="fnref38" role="doc-noteref"><sup>38</sup></a></li>
</ul>
<p>Но для COVID-19 <em>на людях</em>, по состоянию на 1 Мая 2020, "как долго" остаётся большим вопросом.</p>
<p>Допустим для этих симуляций, что это 1 год. <strong>Вот симуляция, начинающаяся со 100% <icon r></icon></strong>, экспоненциально убывающих, становясь неиммунными <icon s></icon>, <em>в среднем, с отклонениями,</em> через 1 год:</p>
@ -402,7 +404,7 @@
<p>Но есть и более серьёзный вопрос:</p>
<p>Что, если вакцины не будет <em>годами</em>? Или и вовсе <em>никогда?</em></p>
<p><strong>Мы уточняем: это крайне маловероятно.</strong> Большинство эпидемиологов считают, что разрабточка вакцины займёт от 1 до 2 лет. Конечно, раньше вакцин от коронавирусов не делали, но это просто потому, что SARS быстро кончился, а "обыкновенная" простуда не стоит таких усилий.</p>
<p>Во всяком случае, исследователи инфекционных заболеваний выражают озабоченность: Что, если нам не хватиит вакцин?<a href="#fn37" class="footnote-ref" id="fnref37" role="doc-noteref"><sup>37</sup></a> Что если мы поспешим, создав небезопасную вакцину?</p>
<p>Во всяком случае, исследователи инфекционных заболеваний выражают озабоченность: Что, если нам не хватиит вакцин?<a href="#fn39" class="footnote-ref" id="fnref39" role="doc-noteref"><sup>39</sup></a> Что если мы поспешим, создав небезопасную вакцину?</p>
<p>Даже в кошмарном сне, когда вакцина отсутствует полностью, у нас есть 3 выхода. От наиболее ужасающих к более благоприятным:</p>
<p>1) Поддерживать количество больных на некотором уровне, чтобы достичь "естественного коллективного иммунитета". (Осторожно: может повлечь за собой много смертей и убитых лёгких. <em>И</em> не будет работать, если иммунитет недостаточно стойкий.)</p>
<p>2) Соблюдать снижающие R меры постоянно. Отслеживание контактов и ношение масок просто станет новой нормой в мире после COVID-19, так же как тесты на ЗППП и ношение презервативов стали новой нормой в мире после ВИЧ.</p>
@ -426,7 +428,7 @@
<div>Сейчас</div>
</div>
</div>
<p><a href="#fn38" class="footnote-ref" id="fnref38" role="doc-noteref"><sup>38</sup></a> Самолёт утонул. Мы перебрались на плоты. Нам нужно найти землю.<a href="#fn39" class="footnote-ref" id="fnref39" role="doc-noteref"><sup>39</sup></a></p>
<p><a href="#fn40" class="footnote-ref" id="fnref40" role="doc-noteref"><sup>40</sup></a> Самолёт утонул. Мы перебрались на плоты. Нам нужно найти землю.<a href="#fn41" class="footnote-ref" id="fnref41" role="doc-noteref"><sup>41</sup></a></p>
<p>Команды эпидемиологов и политиков (<a href="https://www.americanprogress.org/issues/healthcare/news/2020/04/03/482613/national-state-plan-end-coronavirus-crisis/">левых</a>, <a href="https://www.aei.org/research-products/report/national-coronavirus-response-a-road-map-to-reopening/">правых</a>, и <a href="https://ethics.harvard.edu/covid-roadmap">всех вместе</a>) пришли к консенсусу по вопросам борьбы с COVID-19, стараясь защитить наши жизни <em>и</em> свободы.</p>
<p>Вот основные идеи, и некоторые (менее консенсусные) запасные варианты:</p>
<p><img src="pics/plan.png" /></p>
@ -460,45 +462,47 @@
<p>Следовательно, 1 - ПредотвращённыеЗаражения &lt; 1/R<sub>0</sub></p>
<p>Следовательно, ПредотвращённыеЗаражения &gt; 1 - 1/R<sub>0</sub></p>
<p>Следовательно, достаточно остановить больше, чем <strong>1 - 1/R<sub>0</sub></strong> всех заражений, чтобы получить R &lt; 1 и сдержать распространение!<a href="#fnref12" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn13" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.statista.com/statistics/1105420/covid-icu-admission-rates-us-by-age-group/">"Percentage of COVID-19 cases in the United States from February 12 to March 16, 2020 that required intensive care unit (ICU) admission, by age group"</a>. От 4,9% до 11,5% <em>всех</em> случаев COVID-19 нуждались в реанимации. Оптимистично возьмём нижнюю оценку и получим 5% или 1 из 20. Отметим, что это число основано на возрастной пирамиде США, и будет выше в странах со старым населением и ниже в странах с молодым населением.<a href="#fnref13" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn13" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.statista.com/statistics/1105420/covid-icu-admission-rates-us-by-age-group/">"Percentage of COVID-19 cases in the United States from February 12 to March 16, 2020 that required intensive care unit (ICU) admission, by age group"</a>.<a href="#fnref13" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn14" role="doc-endnote"><p>"Число кроватей в отделениях интенсивной терапии = 96 596". Из <a href="https://sccm.org/Blog/March-2020/United-States-Resource-Availability-for-COVID-19">the Society of Critical Care Medicine</a> Население США составляло ~328 миллионов человек в 2019 году. 96 596 к 328 200 000 = около 1 к 3400.<a href="#fnref14" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn15" role="doc-endnote"><p>"Цель такая же, как у других стран: сгладить кривую, растягивая заражение на начальной стадии. Как следствие, у населения выработается коллективный иммунитет; Это побочный эффект, а не цель. [...] План действия правительства, доступный онлайн, вообще не упоминает коллективный иммунитет" (He says that the actual goal is the same as that of other countries: flatten the curve by staggering the onset of infections. As a consequence, the nation may achieve herd immunity; its a side effect, not an aim. [...] The governments actual coronavirus action plan, available online, doesnt mention herd immunity at all.)</p>
<p>Взято из <a href="https://www.theatlantic.com/health/archive/2020/03/coronavirus-pandemic-herd-immunity-uk-boris-johnson/608065/">атьи Эда Йонга в The Atlantic</a><a href="#fnref15" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn16" role="doc-endnote"><p>Это искажение ушло бы, если бы мы изображали R на логарифмической шкале, но тогда нам пришлось бы объяснять <em>логарифмическую шкалу.</em><a href="#fnref16" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn17" role="doc-endnote"><p>"В отсутствие других воздействий, главная метрика успеха социального дистанцирования — это заполненность реанимационных отделений. Чтобы её избежать, постоянный или прерывистый карантин может быть необходим до 2022 года." (Absent other interventions, a key metric for the success of social distancing is whether critical care capacities are exceeded. To avoid this, prolonged or intermittent social distancing may be necessary into 2022.) <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793">Kissler and Tedijanto et al</a><a href="#fnref17" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn18" role="doc-endnote"><p>Смотри <a href="https://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/1745691614568352">Рисунок 6 из работы Holt-Lunstad &amp; Smith 2010</a>. На самом деле, они нашли <em>корреляцию</em> в существующих выборках. Но было бы жестоко проводить рандомизированный контролируемый эксперимент, заставляя людей быть одинокими всю жизнь.<a href="#fnref18" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn19" role="doc-endnote"><p><strong>В среднем 3 дня до заразности:</strong> "Assuming an incubation period distribution of mean 5.2 days from a separate study of early COVID-19 cases, we inferred that infectiousness started from 2.3 days (95% CI, 0.83.0 days) before symptom onset" (перевод: Симптомы начинаются на пятый день, а заразным человек становится за 2 дня до этого = заразным человек становится на третий день) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al.</a></p>
<li id="fn16" role="doc-endnote"><p>"Все 8 доступных исследований сообщают, что мытьё рук снижает риск респираторных инфекций, но оценивают уменьшение риска по-разному, от 6 до 44%. Усреднённое значение составляет 24%, 90-процентный доверительный интервал — 6-40%." (All eight eligible studies reported that handwashing lowered risks of respiratory infection, with risk reductions ranging from 6% to 44% [pooled value 24% (95% CI 640%)].)<a href="#fnref16" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn17" role="doc-endnote"><p>"Мы обнаружили уменьшение в среднем числе контактов на человека в 73%. Этого должно быть достаточно для уменьшения R<sub>0</sub> со значения 2,6 до карантина до 0,62 (0,37 — 0,89)." (We found a 73% reduction in the average daily number of contacts observed per participant. This would be sufficient to reduce R0 from a value from 2,6 before the lockdown to 0,62 (0,37 - 0,89) during the lockdown.) Для простоты мы округлили это число до 70%. <a href="https://cmmid.github.io/topics/covid19/comix-impact-of-physical-distance-measures-on-transmission-in-the-UK.html">Jarvis and Zandvoort et al</a><a href="#fnref17" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn18" role="doc-endnote"><p>Это искажение ушло бы, если бы мы изображали R на логарифмической шкале, но тогда нам пришлось бы объяснять <em>логарифмическую шкалу.</em><a href="#fnref18" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn19" role="doc-endnote"><p>"В отсутствие других воздействий, главная метрика успеха социального дистанцирования — это заполненность реанимационных отделений. Чтобы её избежать, постоянный или прерывистый карантин может быть необходим до 2022 года." (Absent other interventions, a key metric for the success of social distancing is whether critical care capacities are exceeded. To avoid this, prolonged or intermittent social distancing may be necessary into 2022.) <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793">Kissler and Tedijanto et al</a><a href="#fnref19" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn20" role="doc-endnote"><p>Смотри <a href="https://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/1745691614568352">Рисунок 6 из работы Holt-Lunstad &amp; Smith 2010</a>. На самом деле, они нашли <em>корреляцию</em> в существующих выборках. Но было бы жестоко проводить рандомизированный контролируемый эксперимент, заставляя людей быть одинокими всю жизнь.<a href="#fnref20" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn21" role="doc-endnote"><p><strong>В среднем 3 дня до заразности:</strong> "Assuming an incubation period distribution of mean 5.2 days from a separate study of early COVID-19 cases, we inferred that infectiousness started from 2.3 days (95% CI, 0.83.0 days) before symptom onset" (перевод: Симптомы начинаются на пятый день, а заразным человек становится за 2 дня до этого = заразным человек становится на третий день) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al.</a></p>
<p><strong>В среднем 4 дня до заражения кого-нибудь ещё:</strong> "The mean [serial] interval was 3.96 days (95% CI 3.534.39 days)" <a href="https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/6/20-0357_article">Du Z, Xu X, Wu Y, Wang L, Cowling BJ, Ancel Meyers L</a></p>
<p><strong>В среднем 5 дней до первых симптомов:</strong> "The median incubation period was estimated to be 5.1 days (95% CI, 4.5 to 5.8 days)" <a href="https://annals.org/AIM/FULLARTICLE/2762808/INCUBATION-PERIOD-CORONAVIRUS-DISEASE-2019-COVID-19-FROM-PUBLICLY-REPORTED">Lauer SA, Grantz KH, Bi Q, et al</a><a href="#fnref19" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn20" role="doc-endnote"><p>"По нашим оценкам, 44% (при 95%-ом доверительном интервале 25-69%) заражений произошло во время предсимптоматической стадии." (We estimated that 44% (95% confidence interval, 2569%) of secondary cases were infected during the index cases presymptomatic stage) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al</a><a href="#fnref20" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn21" role="doc-endnote"><p>"Отслеживание контактов в Либерии оказалось ключевым методом и представляет собой один из крупнейших примеров отслеживания контактов во время эпидемии в истории." (Contact tracing was a critical intervention in Liberia and represented one of the largest contact tracing efforts during an epidemic in history.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6152989/">Swanson KC, Altare C, Wesseh CS, et al.</a><a href="#fnref21" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn22" role="doc-endnote"><p>"Контакты больного были отслежены с момента его попадания на рейс «Аэрофлота» из Дели до последних дней. Были поимённо установлены не только друзья и знакомые, с которыми он был в контакте, но и таможенники встречавшей его смены, таксист, который вёз его домой, участковый врач и работники поликлиники. Одного из знакомых Кокорекина, отправившегося в Париж, решили снять с рейса «Аэрофлота», когда самолёт был в воздухе. Самолёт развернули, а опасного пассажира и всех, кто был на борту, отправили в карантин." <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/Ликвидация_вспышки_оспы_в_Москве_1959—1960">Ликвидация вспышки оспы в Москве 1959—1960</a><a href="#fnref22" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn23" role="doc-endnote"><p><a href="https://github.com/TCNCoalition/TCN#tcn-protocol">Temporary Contact Numbers, безопасный децентрализованный протокол отслеживания контактов</a><a href="#fnref23" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn24" role="doc-endnote"><p><a href="https://pact.mit.edu/">PACT: Private Automated Contact Tracing</a><a href="#fnref24" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn25" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.apple.com/ca/newsroom/2020/04/apple-and-google-partner-on-covid-19-contact-tracing-technology/">Apple и Google объединились в вопросе отслеживания контактов ради борьбы с COVID-19</a>. Причём они не создают <em>свои</em> приложения, а просто создают системы, которые будут <em>поддерживать</em> эти приложения.<a href="#fnref25" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn26" role="doc-endnote"><p>Многие новостные репортажи — а если честно, и многие научные работы — не делают различия между "случаями, в которых не оказалось симптомов, когда мы их тестировали" (предсимптоматическими) и "случаями, в которых симтпомы <em>вообще</em> не проявились" (настоящие асимптоматические). Единственный способ их отличить — продолжать наблюдения за случаями дольше.</p>
<p><strong>В среднем 5 дней до первых симптомов:</strong> "The median incubation period was estimated to be 5.1 days (95% CI, 4.5 to 5.8 days)" <a href="https://annals.org/AIM/FULLARTICLE/2762808/INCUBATION-PERIOD-CORONAVIRUS-DISEASE-2019-COVID-19-FROM-PUBLICLY-REPORTED">Lauer SA, Grantz KH, Bi Q, et al</a><a href="#fnref21" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn22" role="doc-endnote"><p>"По нашим оценкам, 44% (при 95%-ом доверительном интервале 25-69%) заражений произошло во время предсимптоматической стадии." (We estimated that 44% (95% confidence interval, 2569%) of secondary cases were infected during the index cases presymptomatic stage) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al</a><a href="#fnref22" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn23" role="doc-endnote"><p>"Отслеживание контактов в Либерии оказалось ключевым методом и представляет собой один из крупнейших примеров отслеживания контактов во время эпидемии в истории." (Contact tracing was a critical intervention in Liberia and represented one of the largest contact tracing efforts during an epidemic in history.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6152989/">Swanson KC, Altare C, Wesseh CS, et al.</a><a href="#fnref23" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn24" role="doc-endnote"><p>"Контакты больного были отслежены с момента его попадания на рейс «Аэрофлота» из Дели до последних дней. Были поимённо установлены не только друзья и знакомые, с которыми он был в контакте, но и таможенники встречавшей его смены, таксист, который вёз его домой, участковый врач и работники поликлиники. Одного из знакомых Кокорекина, отправившегося в Париж, решили снять с рейса «Аэрофлота», когда самолёт был в воздухе. Самолёт развернули, а опасного пассажира и всех, кто был на борту, отправили в карантин." <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/Ликвидация_вспышки_оспы_в_Москве_1959—1960">Ликвидация вспышки оспы в Москве 1959—1960</a><a href="#fnref24" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn25" role="doc-endnote"><p><a href="https://github.com/TCNCoalition/TCN#tcn-protocol">Temporary Contact Numbers, безопасный децентрализованный протокол отслеживания контактов</a><a href="#fnref25" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn26" role="doc-endnote"><p><a href="https://pact.mit.edu/">PACT: Private Automated Contact Tracing</a><a href="#fnref26" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn27" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.apple.com/ca/newsroom/2020/04/apple-and-google-partner-on-covid-19-contact-tracing-technology/">Apple и Google объединились в вопросе отслеживания контактов ради борьбы с COVID-19</a>. Причём они не создают <em>свои</em> приложения, а просто создают системы, которые будут <em>поддерживать</em> эти приложения.<a href="#fnref27" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn28" role="doc-endnote"><p>Многие новостные репортажи — а если честно, и многие научные работы — не делают различия между "случаями, в которых не оказалось симптомов, когда мы их тестировали" (предсимптоматическими) и "случаями, в которых симтпомы <em>вообще</em> не проявились" (настоящие асимптоматические). Единственный способ их отличить — продолжать наблюдения за случаями дольше.</p>
<p>Именно так и поступают <a href="https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/8/20-1274_article">в этом исследовании</a>. (Дисклеймер: статьи с ранним доступом могут отличаться от финальной версии) Во время вспышки COVID-19 в колл-центре в Южной Корее "только четверо (1,9%) так и остались асимптоматическими после 14 дней карантина, и никто их их домочадцев не пробрёл вторичной инфекции."</p>
<p>Итак, "настоящие асимптоматические" редки, а подхватить болезнь у асимптоматика — ещё большая редкость!<a href="#fnref26" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn27" role="doc-endnote"><p>Из того же Оксфордского исследования, которое порекомендовало использовать приложения для борьбы с COVID-19: <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936/tab-figures-data">Luca Ferretti &amp; Chris Wymant et al</a> См. рис. 2. В предположении, что R<sub>0</sub> = 2,0, они обнаружили, что:</p>
<p>Итак, "настоящие асимптоматические" редки, а подхватить болезнь у асимптоматика — ещё большая редкость!<a href="#fnref28" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn29" role="doc-endnote"><p>Из того же Оксфордского исследования, которое порекомендовало использовать приложения для борьбы с COVID-19: <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936/tab-figures-data">Luca Ferretti &amp; Chris Wymant et al</a> См. рис. 2. В предположении, что R<sub>0</sub> = 2,0, они обнаружили, что:</p>
<ul>
<li>Симптоматики дают вклад R = 0,8 (40%)</li>
<li>Предсимптоматики дают вклад R = 0,9 (45%)</li>
<li>Асимптоматики дают вклад R = 0,1 (5%, хотя их модель включает в себя неопределённость и это число может быть куда меньше)</li>
<li>Заражение из окружающей среды вроде дверных ручек дают вклад R = 0,2 (10%)</li>
</ul>
<p>Если сложить пред- и асимптоматические контакты (45% + 5%), получится 50% от R!<a href="#fnref27" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn28" role="doc-endnote"><p>"Никакая из представляенных хирургических масок не фильтрует и не прилегает к лицу достаточно хорошо, чтобы считаться средством респираторной защиты" (None of these surgical masks exhibited adequate filter performance and facial fit characteristics to be considered respiratory protection devices.) <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0196655307007742">Tara Oberg &amp; Lisa M. Brosseau</a><a href="#fnref28" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn29" role="doc-endnote"><p>"Сокращение на 70% числа копий в аэрозоле, которое мы увидели, вкупе с почти полным исчезновением крупных капель, продемострированным в статье Джонсона, Дрюса, Бёрча и Грейсона, позволяет предположить, что хирургические маски, надетые на инфицированного человека, могут оказывать клинически значимый эффект на передачу заболевания." (The overall 3.4 fold reduction [70% reduction] in aerosol copy numbers we observed combined with a nearly complete elimination of large droplet spray demonstrated by Johnson et al. suggests that surgical masks worn by infected persons could have a clinically significant impact on transmission.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3591312/">Milton DK, Fabian MP, Cowling BJ, Grantham ML, McDevitt JJ</a><a href="#fnref29" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn30" role="doc-endnote"><p>Любой учёный, кто читает последнее предложение, вероятно смеётся сквозь слёзы прямо сейчас. Смотри <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Data_dredging">p-hacking</a> <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Replication_crisis">the replication crisis</a>)<a href="#fnref30" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn31" role="doc-endnote"><p><strong>"Мы должны сохранить резервные запасы для больниц!"</strong> <em>"Полностью согласны",</em> но это скорее спор по поводу увеличения производства масок, не об их рачительном испольовании. Пока суть да дело, можно делать маски из ткани.<a href="#fnref31" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn32" role="doc-endnote"><p>"Повышение температуры на один градус по Цельсию [...] понижает R на 0,0225" и "Среднее значение R в этих 100 городах составляет 1,83" 0,0225 ÷ 1,83 = ~1,2%. <a href="https://papers.ssrn.com/sol3/Papers.cfm?abstract_id=3551767">Wang, Jingyuan and Tang, Ke and Feng, Kai and Lv, Weifeng</a><a href="#fnref32" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn33" role="doc-endnote"><p>"SARS-специфические антитела поддерживались на протяжении 2 лет [...] Значит, SARS пациенты могут заразиться повторно после 3 лет после начального заражения." (SARS-specific antibodies were maintained for an average of 2 years [...] Thus, SARS patients might be susceptible to reinfection ≥3 years after initial exposure.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851497/">Wu LP, Wang NC, Chang YH, et al.</a>. "К сожалению", мы никогда не узнаем сколько продлился бы иммунитет от SARS, поскольку мы довольно быстро искоренили его.<a href="#fnref33" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn34" role="doc-endnote"><p>"Мы не обнаружили существенной разницы между вероятностью срабатывания теста хотя бы однажды и вероятность возвращения для бета-коронавирусов HKU1 и OC43 на 34 неделе после первого заражения." (We found no significant difference between the probability of testing positive at least once and the probability of a recurrence for the beta-coronaviruses HKU1 and OC43 at 34 weeks after enrollment/first infection.) <a href="http://www.columbia.edu/~jls106/galanti_shaman_ms_supp.pdf">Marta Galanti &amp; Jeffrey Shaman (PDF)</a><a href="#fnref34" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn35" role="doc-endnote"><p>"Пока человек только поборол вирус, его частицы могут оставаться в организме. Они не могут привести к инфекции, но могут вызвать срабатывание теста." (Once a person fights off a virus, viral particles tend to linger for some time. These cannot cause infections, but they can trigger a positive test.) <a href="https://www.statnews.com/2020/04/20/everything-we-know-about-coronavirus-immunity-and-antibodies-and-plenty-we-still-dont/">from STAT News by Andrew Joseph</a><a href="#fnref35" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn36" role="doc-endnote"><p>Из <a href="https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990226v1.abstract">Bao et al.</a> <em>Дисклеймер: Эта статья является препринтом и не была подвержена рецензированию.</em> Мы обращаем ваше внимание, что они проверяли повторное заражение только через 28 дней.<a href="#fnref36" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn37" role="doc-endnote"><p>"Когда изобретут вакцину от коронавируса, сможем ли мы произвести её в достаточном количестве?" (If a coronavirus vaccine arrives, can the world make enough?) <a href="https://www.nature.com/articles/d41586-020-01063-8">by Roxanne Khamsi, on Nature</a><a href="#fnref37" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn38" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref38" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn39" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref39" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<p>Если сложить пред- и асимптоматические контакты (45% + 5%), получится 50% от R!<a href="#fnref29" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn30" role="doc-endnote"><p>"Никакая из представляенных хирургических масок не фильтрует и не прилегает к лицу достаточно хорошо, чтобы считаться средством респираторной защиты" (None of these surgical masks exhibited adequate filter performance and facial fit characteristics to be considered respiratory protection devices.) <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0196655307007742">Tara Oberg &amp; Lisa M. Brosseau</a><a href="#fnref30" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn31" role="doc-endnote"><p>"Сокращение на 70% числа копий в аэрозоле, которое мы увидели, вкупе с почти полным исчезновением крупных капель, продемострированным в статье Джонсона, Дрюса, Бёрча и Грейсона, позволяет предположить, что хирургические маски, надетые на инфицированного человека, могут оказывать клинически значимый эффект на передачу заболевания." (The overall 3.4 fold reduction [70% reduction] in aerosol copy numbers we observed combined with a nearly complete elimination of large droplet spray demonstrated by Johnson et al. suggests that surgical masks worn by infected persons could have a clinically significant impact on transmission.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3591312/">Milton DK, Fabian MP, Cowling BJ, Grantham ML, McDevitt JJ</a><a href="#fnref31" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn32" role="doc-endnote"><p>Любой учёный, кто читает последнее предложение, вероятно смеётся сквозь слёзы прямо сейчас. Смотри <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Data_dredging">p-hacking</a> <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Replication_crisis">the replication crisis</a>)<a href="#fnref32" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn33" role="doc-endnote"><p><strong>"Мы должны сохранить резервные запасы для больниц!"</strong> <em>"Полностью согласны",</em> но это скорее спор по поводу увеличения производства масок, не об их рачительном испольовании. Пока суть да дело, можно делать маски из ткани.<a href="#fnref33" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn34" role="doc-endnote"><p>"Повышение температуры на один градус по Цельсию [...] понижает R на 0,0225" и "Среднее значение R в этих 100 городах составляет 1,83" 0,0225 ÷ 1,83 = ~1,2%. <a href="https://papers.ssrn.com/sol3/Papers.cfm?abstract_id=3551767">Wang, Jingyuan and Tang, Ke and Feng, Kai and Lv, Weifeng</a><a href="#fnref34" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn35" role="doc-endnote"><p>"SARS-специфические антитела поддерживались на протяжении 2 лет [...] Значит, SARS пациенты могут заразиться повторно после 3 лет после начального заражения." (SARS-specific antibodies were maintained for an average of 2 years [...] Thus, SARS patients might be susceptible to reinfection ≥3 years after initial exposure.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851497/">Wu LP, Wang NC, Chang YH, et al.</a>. "К сожалению", мы никогда не узнаем сколько продлился бы иммунитет от SARS, поскольку мы довольно быстро искоренили его.<a href="#fnref35" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn36" role="doc-endnote"><p>"Мы не обнаружили существенной разницы между вероятностью срабатывания теста хотя бы однажды и вероятность возвращения для бета-коронавирусов HKU1 и OC43 на 34 неделе после первого заражения." (We found no significant difference between the probability of testing positive at least once and the probability of a recurrence for the beta-coronaviruses HKU1 and OC43 at 34 weeks after enrollment/first infection.) <a href="http://www.columbia.edu/~jls106/galanti_shaman_ms_supp.pdf">Marta Galanti &amp; Jeffrey Shaman (PDF)</a><a href="#fnref36" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn37" role="doc-endnote"><p>"Пока человек только поборол вирус, его частицы могут оставаться в организме. Они не могут привести к инфекции, но могут вызвать срабатывание теста." (Once a person fights off a virus, viral particles tend to linger for some time. These cannot cause infections, but they can trigger a positive test.) <a href="https://www.statnews.com/2020/04/20/everything-we-know-about-coronavirus-immunity-and-antibodies-and-plenty-we-still-dont/">from STAT News by Andrew Joseph</a><a href="#fnref37" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn38" role="doc-endnote"><p>Из <a href="https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990226v1.abstract">Bao et al.</a> <em>Дисклеймер: Эта статья является препринтом и не была подвержена рецензированию.</em> Мы обращаем ваше внимание, что они проверяли повторное заражение только через 28 дней.<a href="#fnref38" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn39" role="doc-endnote"><p>"Когда изобретут вакцину от коронавируса, сможем ли мы произвести её в достаточном количестве?" (If a coronavirus vaccine arrives, can the world make enough?) <a href="https://www.nature.com/articles/d41586-020-01063-8">by Roxanne Khamsi, on Nature</a><a href="#fnref39" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn40" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref40" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn41" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref41" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
</ol>
</section>

View File

@ -35,9 +35,22 @@
<ul>
<!-- IF YOU'RE MAKING A TRANSLATION, UN-COMMENT THE NEXT LINE -->
<li><a href='https://ncase.me/covid-19/'>English (original version)</a></li>
<li><a href='https://eed3si9n.github.io/covid-19/'>日本語</a></li>
<li><a href='https://vrruiz.github.io/covid-19'>Español</a></li>
<li><a href='https://leonardoalcantara.github.io/covid-19-pt-br/'>Português</a></li>
<li><a href='https://tquev.github.io/covid-19/'>Deutsch</a></li>
<li><a href='https://harisont.github.io/covid-19/'>Italiano</a></li>
<li><a href='https://jusplathemus.github.io/covid-19/'>Magyar</a></li>
<li><a href='https://covid19-next.coddk.org/'>മലയാളം</a></li>
<li><a href='https://dcz-self.github.io/covid-19/'>Polski</a></li>
<li><a href='https://saskaaloric.github.io/covid-19/'>Srpski</a></li>
<li><a href='https://mehdi-mostafavi.github.io/covid-19/'>فارسی</a></li>
<li><a href='https://xmac11.github.io/covid-19/'>Ελληνικά</a></li>
<li><a href='https://asherbarak.github.io/covid-19/'>עברית</a></li>
<li><a href='https://benbennben.github.io/covid-19/'>한국어</a></li>
<li><a href='https://eed3si9n.github.io/covid-19/'>日本語</a></li>
<li><a href='https://fuhsuann.github.io/covid-19/'>繁體中文</a></li>
<li><a href='https://brodafly.github.io/covid-19/'>Български</a></li>
<li><a href='https://m0stik.github.io/covid-19/'>Українська</a></li>
</ul>
<a href='https://github.com/ncase/covid-19#how-to-translate'>
Помочь с переводом?

View File

@ -131,6 +131,7 @@
<p>...могли бы быть хуже. Вот параллельная вселенная, которой мы избежали:</p>
<h3>Сценарий 0: Не делать ничего</h3>
<p>Около 1 из 20 людей заражённых COVID-19 нуждаются в реанимации.<a href="#fn13" class="footnote-ref" id="fnref13" role="doc-noteref"><sup>13</sup></a> В богатых странах вроде США одна кровать в реанимационном отделении приходится на 3400 людей.<a href="#fn14" class="footnote-ref" id="fnref14" role="doc-noteref"><sup>14</sup></a> Следовательно, США могут выдержать 20 больных на 3400 людей <em>одновременно</em> — другими словами около 0,6% населения.</p>
<p>От 4,9% до 11,5% <em>всех</em> случаев COVID-19 нуждались в реанимации. Оптимистично возьмём нижнюю оценку и получим 5% или 1 из 20. Отметим, что это число основано на возрастной пирамиде США, и будет выше в странах со старым населением и ниже в странах с молодым населением.</p>
<p>Даже если мы <em>более чем утроим</em> это число и примем его за 2%, вот что могло бы случиться, <em>если бы мы ничего не делали:</em></p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-1&format=lines" width="800" height="540"></iframe>
@ -143,8 +144,9 @@
<p>План "Сгладить кривую" (Flatten the curve) рекламируют все организации здравоохранения, а брттанский план "Коллективного иммунитета" (herd immunity) все ругали. Это был <em>один и тот же план.</em> Великобритания просто плохо его объяснила.<a href="#fn15" class="footnote-ref" id="fnref15" role="doc-noteref"><sup>15</sup></a></p>
<p>Тем не менее, оба плана содержат буквально фатальный недостаток.</p>
<p>Давайте вначале посмотрим на два главных способа "сгладить кривую": мытьё рук и соблюдение дистанции.</p>
<p>Частое мытьё рук снижает гриппы и простуды на ~25%[^handwashing], а введение жёсткого карантина в Лондоне сократило количество близких контактов на 70%[^london]. Давайте предположим, что мытьё рук уменьшает R на 25% <em>или меньше</em>, а дистанцирование на 70% <em>или меньше</em>: [^handwashing]: "Все 8 доступных исследований сообщают, что мытьё рук снижает риск респираторных инфекций, но оценивают уменьшение риска по-разному, от 6 до 44%. Усреднённое значение составляет 24%, 90-процентный доверительный интервал — 6-40%." (All eight eligible studies reported that handwashing lowered risks of respiratory infection, with risk reductions ranging from 6% to 44% [pooled value 24% (95% CI 640%)].) Мы округлили усреднённое значение до 25% для простоты. <a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-3156.2006.01568.x">Rabie, T. и Curtis, V.</a> Обратите внимание, в этом метаанализе указывают на ужасное качество исследований мытья рук. [^london]: "Мы обнаружили уменьшение в среднем числе контактов на человека в 73%. Этого должно быть достаточно для уменьшения R<sub>0</sub> со значения 2,6 до карантина до 0,62 (0,37 — 0,89)." (We found a 73% reduction in the average daily number of contacts observed per participant. This would be sufficient to reduce R0 from a value from 2,6 before the lockdown to 0,62 (0,37 - 0,89) during the lockdown.) Для простоты мы округлили это число до 70%. <a href="https://cmmid.github.io/topics/covid19/comix-impact-of-physical-distance-measures-on-transmission-in-the-UK.html">Jarvis and Zandvoort et al</a></p>
<p><strong>Поиграйте с этим калькулятором, чтобы увидеть как % не-<icon s></icon>, мытьё рук и дистанцирование уменьшают R:</strong> (этот калькулятор визуализирует <em>относительные</em> эффекты, поэтому кажется, что увеличение некоторых эффектов выглядит как уменьшение других).<a href="#fn16" class="footnote-ref" id="fnref16" role="doc-noteref"><sup>16</sup></a>)</p>
<p>Частое мытьё рук снижает гриппы и простуды на ~25%<a href="#fn16" class="footnote-ref" id="fnref16" role="doc-noteref"><sup>16</sup></a>, а введение жёсткого карантина в Лондоне сократило количество близких контактов на 70%<a href="#fn17" class="footnote-ref" id="fnref17" role="doc-noteref"><sup>17</sup></a>. Давайте предположим, что мытьё рук уменьшает R на 25% <em>или меньше</em>, а дистанцирование на 70% <em>или меньше</em>:</p>
<p>Мы округлили усреднённое значение до 25% для простоты. <a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-3156.2006.01568.x">Rabie, T. и Curtis, V.</a> Обратите внимание, в этом метаанализе указывают на ужасное качество исследований мытья рук.</p>
<p><strong>Поиграйте с этим калькулятором, чтобы увидеть как % не-<icon s></icon>, мытьё рук и дистанцирование уменьшают R:</strong> (этот калькулятор визуализирует <em>относительные</em> эффекты, поэтому кажется, что увеличение некоторых эффектов выглядит как уменьшение других).<a href="#fn18" class="footnote-ref" id="fnref18" role="doc-noteref"><sup>18</sup></a>)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-2a&format=calc" width="285" height="260"></iframe>
</div>
@ -171,14 +173,14 @@
<p><strong>Карантин — это не лечение. Это перезапуск.</strong></p>
<p>А что если мы будем вводить карантин снова и снова?</p>
<h3>Сценарий 3: Прерывистый карантин</h3>
<p>Это решение впервые предложено в отчете Имперского колледжа Лондона 16 марта, а потом в статье ученых из Гарварда.<a href="#fn17" class="footnote-ref" id="fnref17" role="doc-noteref"><sup>17</sup></a></p>
<p>Это решение впервые предложено в отчете Имперского колледжа Лондона 16 марта, а потом в статье ученых из Гарварда.<a href="#fn19" class="footnote-ref" id="fnref19" role="doc-noteref"><sup>19</sup></a></p>
<p><strong>Посмотрим на симуляцию:</strong> (После воспроизведения записанного сценария вы можете просимулировать <em>собственное</em> расписание карантина, двигая ползунки, пока идёт симуляция! Вы можете ставить симуляцию на паузу и менять её скорость.)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-4&format=lines" width="800" height="540"></iframe>
</div>
<p>Это <em>позволит</em> избежать переполнения реанимаций! И это <em>сильно лучше</em> чем 18-месячный карантин до изобретения вакцины. Нам надо просто... не выходить из дома несколько месяцев, потом жить как обычно несколько месяцев. Повторять, пока вакцина не будет готова. (И если вакцину не изобретут, повторять, пока мы не достигнем коллективного иммунитета... в 2022 году.)</p>
<p>Конечно здорово нарисовать линию "Вместимость отделений реанимации", но есть много важных вещей, которых мы <em>не можем</em> просимулировать здесь. Например:</p>
<p><strong>Психическое здоровье:</strong> Одиночество — это один из главных факторов риска развития депрессии, стресса и самоубийств. И оно влияет на раннюю смерть как 15 сигарет в день.<a href="#fn18" class="footnote-ref" id="fnref18" role="doc-noteref"><sup>18</sup></a></p>
<p><strong>Психическое здоровье:</strong> Одиночество — это один из главных факторов риска развития депрессии, стресса и самоубийств. И оно влияет на раннюю смерть как 15 сигарет в день.<a href="#fn20" class="footnote-ref" id="fnref20" role="doc-noteref"><sup>20</sup></a></p>
<p><strong>Финансовое состояние:</strong> "А как же экономика?!" — звучит будто вам деньги важнее жизней. Но "экономика" — это не просто акции: это про возможность людей давать жильё и еду тем, кого они любят, вкладывать в будущее своих детей, наслаждаться искусством, едой и видеоиграми — всем тем, что делает жизнь осмысленной. И кроме того, бедность <em>сама по себе</em> оказывает ужасное влияние на физическое и психическое здоровье.</p>
<p>Мы не говорим, что мы <em>не должны</em> самоизолироваться! Мы посмотрим на "периодический" карантин позже. Он всё ещё не идеален.</p>
<p>Но подождите... Разве Тайвань и Южная Корея <em>уже не победили</em> COVID-19? За 4 месяца и <em>без</em> длительного карантина?</p>
@ -186,14 +188,14 @@
<h3>Сценарий 4: Тестировать, отслеживать, изолировать</h3>
<p><em>"Конечно, мы *могли бы* сделать то, что Тайвань и Южная Корея сделали с самого начала, но уже слишком поздно. Мы упустили начало."</em></p>
<p>Но всё складывается! "Карантин — это не лечение. Это перезапуск."... <strong>А перезапуск нам и нужен!</strong></p>
<p>Чтобы понять как Тайвань и Южная Корея сдержали COVID-19, нам надо понять типичное развитие болезни<a href="#fn19" class="footnote-ref" id="fnref19" role="doc-noteref"><sup>19</sup></a>:</p>
<p>Чтобы понять как Тайвань и Южная Корея сдержали COVID-19, нам надо понять типичное развитие болезни<a href="#fn21" class="footnote-ref" id="fnref21" role="doc-noteref"><sup>21</sup></a>:</p>
<p><img src="pics/timeline1.png" /></p>
<p>Если больные приступают к самоизоляции только когда понимают, что больны (то есть, когда чувствуют симптомы), вирус всё ещё может распространяться:</p>
<p><img src="pics/timeline2.png" /></p>
<p>И на самом деле, 44% всех передач вируса именно что <em>пред</em>-симптоматические!<a href="#fn20" class="footnote-ref" id="fnref20" role="doc-noteref"><sup>20</sup></a></p>
<p>И на самом деле, 44% всех передач вируса именно что <em>пред</em>-симптоматические!<a href="#fn22" class="footnote-ref" id="fnref22" role="doc-noteref"><sup>22</sup></a></p>
<p>Но если нам удаётся отследить <em>и поместить в карантин</em> людей, которые недавно контактировали с заболевшим... мы останавливаем распостранение, оказываясь на шаг впереди вируса!</p>
<p><img src="pics/timeline3.png" /></p>
<p>Это называется <strong>отслеживанием контактов</strong>. Это старая идея, нашедшая весьма масштабные применения во время вспышки Эболы<a href="#fn21" class="footnote-ref" id="fnref21" role="doc-noteref"><sup>21</sup></a>, и сейчас она является основным средством, с помощью которого Тайвань и Южная Корея сдерживают COVID-19! (Таким же образом в СССР за месяц сдержали вспышку оспы в Москве 1959—1960<a href="#fn22" class="footnote-ref" id="fnref22" role="doc-noteref"><sup>22</sup></a><em>прим. пер.</em>)</p>
<p>Это называется <strong>отслеживанием контактов</strong>. Это старая идея, нашедшая весьма масштабные применения во время вспышки Эболы<a href="#fn23" class="footnote-ref" id="fnref23" role="doc-noteref"><sup>23</sup></a>, и сейчас она является основным средством, с помощью которого Тайвань и Южная Корея сдерживают COVID-19! (Таким же образом в СССР за месяц сдержали вспышку оспы в Москве 1959—1960<a href="#fn24" class="footnote-ref" id="fnref24" role="doc-noteref"><sup>24</sup></a><em>прим. пер.</em>)</p>
<p>(Отслеживание также позволяет более эффективно расходовать ограниченное количество тестов, чтобы отследить предсимптоматических <icon i></icon>, не тестируя почти всё население.)</p>
<p>Изначально контакты отслеживались с помощью личных интервью, но <em>сами по себе</em> интервью недостаточно быстры для ~48-часового окна COVID-19. Именно поэтому отслеживателям контактов нужна помощь, и их можно дополнить — <em>не</em> заменить — отслеживающими приложениями.</p>
<p>Это не идея технарей, которым лишь бы разработать приложение: впервые использовать приложение для борьбы с COVID-19 предложила <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936">команда Оксфордских эпидемиологов</a>.</p>
@ -202,10 +204,10 @@
<p>Работает оно так:</p>
<p><img src="pics/dp3t.png" /></p>
<p>(<a href="https://ncase.me/contact-tracing/">полная версия комикса (на английском) здесь</a>)</p>
<p>Вместе с подобными командами вроде TCN Protocol<a href="#fn23" class="footnote-ref" id="fnref23" role="doc-noteref"><sup>23</sup></a> и MIT PACT<a href="#fn24" class="footnote-ref" id="fnref24" role="doc-noteref"><sup>24</sup></a>, они вдохновили Apple и Google встроить безопасное отслеживание контактов прямо в Androis/iOS.<a href="#fn25" class="footnote-ref" id="fnref25" role="doc-noteref"><sup>25</sup></a>. Вскоре ваше местное управление здравоохранения сможет попросить вас загрузить подобное приложение. Если это и впрямь будет безопасное приложение с открытым кодом, непременно сделайте это!</p>
<p>Вместе с подобными командами вроде TCN Protocol<a href="#fn25" class="footnote-ref" id="fnref25" role="doc-noteref"><sup>25</sup></a> и MIT PACT<a href="#fn26" class="footnote-ref" id="fnref26" role="doc-noteref"><sup>26</sup></a>, они вдохновили Apple и Google встроить безопасное отслеживание контактов прямо в Androis/iOS.<a href="#fn27" class="footnote-ref" id="fnref27" role="doc-noteref"><sup>27</sup></a>. Вскоре ваше местное управление здравоохранения сможет попросить вас загрузить подобное приложение. Если это и впрямь будет безопасное приложение с открытым кодом, непременно сделайте это!</p>
<p>А люди без смартфонов? А инфицированные дверные ручки? А "настоящие" асимптоматические случаи? Приложения, отслеживающие контакты, не могут поймать все передачи... <em>Но ничего страшного!</em> Нам не нужно ловить <em>все</em> передачи, хватит и 60+%, чтобы достичь R &lt; 1.</p>
<p>(Нытьё о путанице между предсимптоматическими и "настоящими" асимптоматическими. "Настоящие" асимптоматические случаи редки:<a href="#fn26" class="footnote-ref" id="fnref26" role="doc-noteref"><sup>26</sup></a>)</p>
<p>Изоляция <em>симптоматических</em> случаев может уменьшить R на 40%, а помещение в карантин их <em>предсимптоматичеких</em> контактёров может уменьшить R на 50%<a href="#fn27" class="footnote-ref" id="fnref27" role="doc-noteref"><sup>27</sup></a>:</p>
<p>(Нытьё о путанице между предсимптоматическими и "настоящими" асимптоматическими. "Настоящие" асимптоматические случаи редки:<a href="#fn28" class="footnote-ref" id="fnref28" role="doc-noteref"><sup>28</sup></a>)</p>
<p>Изоляция <em>симптоматических</em> случаев может уменьшить R на 40%, а помещение в карантин их <em>предсимптоматичеких</em> контактёров может уменьшить R на 50%<a href="#fn29" class="footnote-ref" id="fnref29" role="doc-noteref"><sup>29</sup></a>:</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-4a&format=calc" width="285" height="340"></iframe>
</div>
@ -235,23 +237,23 @@
<p>Не забывайте, что даже если мы не можем добиться R &lt; 1, уменьшение R всё равно уменьшает общее число случаев, спасая жизни. Но всё равно, R &lt; 1 — это идеал, так что вот ещё способы снизить R:</p>
<p><strong>Маски для всех</strong></p>
<p><em>"Стойте,"</em> — скажете вы: <em>"я думал, что маска не защитит меня от заражения?"</em></p>
<p>Действительно. Маски не защищают тебя от заражения<a href="#fn28" class="footnote-ref" id="fnref28" role="doc-noteref"><sup>28</sup></a>, они не дают тебе заражать <em>других</em>.</p>
<p>Действительно. Маски не защищают тебя от заражения<a href="#fn30" class="footnote-ref" id="fnref30" role="doc-noteref"><sup>30</sup></a>, они не дают тебе заражать <em>других</em>.</p>
<p><img src="pics/masks.png" /></p>
<p>Облекая в числа: хирургические маски <em>на больном человеке</em> уменьшают количество вирусов гриппа и простуды в аэрозоле на 70%.<a href="#fn29" class="footnote-ref" id="fnref29" role="doc-noteref"><sup>29</sup></a> Уменьшение передачи на 70% — это такой же эффект как от жёсткого карантина!</p>
<p>Однако мы не знаем наверняка эффект масок <em>именно</em> на COVID-19. В науке следует публиковать открытие, если ты в нём уверен на 95%. (Следует...<a href="#fn30" class="footnote-ref" id="fnref30" role="doc-noteref"><sup>30</sup></a>) Маски, по состоянию на май 2020, не проходят рубеж в 95%.</p>
<p>Облекая в числа: хирургические маски <em>на больном человеке</em> уменьшают количество вирусов гриппа и простуды в аэрозоле на 70%.<a href="#fn31" class="footnote-ref" id="fnref31" role="doc-noteref"><sup>31</sup></a> Уменьшение передачи на 70% — это такой же эффект как от жёсткого карантина!</p>
<p>Однако мы не знаем наверняка эффект масок <em>именно</em> на COVID-19. В науке следует публиковать открытие, если ты в нём уверен на 95%. (Следует...<a href="#fn32" class="footnote-ref" id="fnref32" role="doc-noteref"><sup>32</sup></a>) Маски, по состоянию на май 2020, не проходят рубеж в 95%.</p>
<p>Однако, пандемии — они как покер, <strong>Если ты делаешь ставки только когда на 95% уверен, то ты проиграешь.</strong> Как замечает недавняя статья про маски в Британском Медицинском Журнале, мы <em>вынуджены</em> проводить анализ стоимости и воздействия в условиях неопределённости. Например:</p>
<p>Стоимость: самодельные тканевые маски (достигающие ~2/3 эффективности относительно хирургических масок), очень дёшевы. Хирургические маски дороже, но они всё ещё дешёвые.</p>
<p>Воздействие: Даже если у нас шансы 50-50, что хирургические маски снижают интенсивность передачи вируса на 0 или 70 процентов, среднее "ожидание" всё ещё 35%, как у половины самоизоляции! Так что давайте, ткнув пальцем в небо, посчитаем, что хирургические маски понижают R на 35%, со скидкой на неопределённость. (Как обычно, можете взять свои числа, двигая ползунки вверх-вниз)</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-6a&format=calc" width="285" height="380"></iframe>
</div>
<p>(прочие аругменты за и против масок: <a href="#fn31" class="footnote-ref" id="fnref31" role="doc-noteref"><sup>31</sup></a>)</p>
<p>(прочие аругменты за и против масок: <a href="#fn33" class="footnote-ref" id="fnref33" role="doc-noteref"><sup>33</sup></a>)</p>
<p><strong>"Их тяжело правильно носить."</strong> А ещё тяжело мыть руки, полностью придерживаясь рекомендаций ВОЗ — смотрите сами, "Шаг 3 (из 12): Правой ладонью растирать тыльную поверхность левой руки, переплетя пальцы, и наоборот." Но мы всё равно настоятельно рекомендуем мыть руки, потому что даже неидеальные меры лучше, чем ничего.</p>
<p><strong>Из-за этого люди станут менее серьёзно относиться к мытью рук и социальному дистанцированию</strong>. Само собой, так же, как люди в ремнях безопасности меньше обращают внимания на дорожные знаки, а после использования зубной нити готовы есть камни. На самом деле, мы утверждаем обратное: маски своим присутствием <em>вечно напоминают об осторожности</em>, а в Восточной Азии они стали символом солидарности!</p>
<p>Маски <em>сами по себе</em> не сделают R &lt; 1. Но если мытьё рук и "Тестировать, отслеживать, изолировать" дадут нам R = 1,10, то если к тому же каждый третий наденет маску, ситуация перевернётся за рубеж R &lt; 1, то есть вирус побеждён!</p>
<p><strong>Лето:</strong></p>
<p>Безусловно, это не то "вмешательство", на которое мы можем повлиять, но оно непременно поможет! Некоторые новостные издания сообщают, что COVID-19 лето нипочём. Они наполовину правы: из-за лета R не станет &lt; 1, но оно <em>точно</em> снизит R.</p>
<p>Для COVID-19, повышение температуры на 1°C понижает R на 1,2%.<a href="#fn32" class="footnote-ref" id="fnref32" role="doc-noteref"><sup>32</sup></a> Разница температур между зимой и летом в Нью-Йорке составляет 15°С, так что R должен снизиться на 18%. Для Москвы эти цифры составляют 26°C и 31% соответственно.</p>
<p>Для COVID-19, повышение температуры на 1°C понижает R на 1,2%.<a href="#fn34" class="footnote-ref" id="fnref34" role="doc-noteref"><sup>34</sup></a> Разница температур между зимой и летом в Нью-Йорке составляет 15°С, так что R должен снизиться на 18%. Для Москвы эти цифры составляют 26°C и 31% соответственно.</p>
<div class="sim">
<iframe src="sim?stage=int-6b&format=calc" width="285" height="220"></iframe>
</div>
@ -291,10 +293,10 @@
<p>Вы подхватили COVID-19 и выздоровели. Или вам поставили прививку. В любом случае у вас иммунитет...</p>
<p>...<em>Надолго ли?</em></p>
<ul>
<li>COVID-19 является близким родственником SARS, который давал переболевшим 2 года иммунитета.<a href="#fn33" class="footnote-ref" id="fnref33" role="doc-noteref"><sup>33</sup></a></li>
<li>Коронавирусы, которые вызывают "обычную" простуду могут дать вплоть до 8 месяцев иммунитета.<a href="#fn34" class="footnote-ref" id="fnref34" role="doc-noteref"><sup>34</sup></a></li>
<li>Есть репортажи о людях, которые переболели COVID-19, а потом сновы получили положительный тест, но эти результаты могут оказаться ложноположительными.<a href="#fn35" class="footnote-ref" id="fnref35" role="doc-noteref"><sup>35</sup></a></li>
<li>Одно <em>неотрецензированное</em> исследование на обезьянах говорит о как минимум 28-дневном иммунитете к COVID-19.<a href="#fn36" class="footnote-ref" id="fnref36" role="doc-noteref"><sup>36</sup></a></li>
<li>COVID-19 является близким родственником SARS, который давал переболевшим 2 года иммунитета.<a href="#fn35" class="footnote-ref" id="fnref35" role="doc-noteref"><sup>35</sup></a></li>
<li>Коронавирусы, которые вызывают "обычную" простуду могут дать вплоть до 8 месяцев иммунитета.<a href="#fn36" class="footnote-ref" id="fnref36" role="doc-noteref"><sup>36</sup></a></li>
<li>Есть репортажи о людях, которые переболели COVID-19, а потом сновы получили положительный тест, но эти результаты могут оказаться ложноположительными.<a href="#fn37" class="footnote-ref" id="fnref37" role="doc-noteref"><sup>37</sup></a></li>
<li>Одно <em>неотрецензированное</em> исследование на обезьянах говорит о как минимум 28-дневном иммунитете к COVID-19.<a href="#fn38" class="footnote-ref" id="fnref38" role="doc-noteref"><sup>38</sup></a></li>
</ul>
<p>Но для COVID-19 <em>на людях</em>, по состоянию на 1 Мая 2020, "как долго" остаётся большим вопросом.</p>
<p>Допустим для этих симуляций, что это 1 год. <strong>Вот симуляция, начинающаяся со 100% <icon r></icon></strong>, экспоненциально убывающих, становясь неиммунными <icon s></icon>, <em>в среднем, с отклонениями,</em> через 1 год:</p>
@ -324,7 +326,7 @@
<p>Но есть и более серьёзный вопрос:</p>
<p>Что, если вакцины не будет <em>годами</em>? Или и вовсе <em>никогда?</em></p>
<p><strong>Мы уточняем: это крайне маловероятно.</strong> Большинство эпидемиологов считают, что разрабточка вакцины займёт от 1 до 2 лет. Конечно, раньше вакцин от коронавирусов не делали, но это просто потому, что SARS быстро кончился, а "обыкновенная" простуда не стоит таких усилий.</p>
<p>Во всяком случае, исследователи инфекционных заболеваний выражают озабоченность: Что, если нам не хватиит вакцин?<a href="#fn37" class="footnote-ref" id="fnref37" role="doc-noteref"><sup>37</sup></a> Что если мы поспешим, создав небезопасную вакцину?</p>
<p>Во всяком случае, исследователи инфекционных заболеваний выражают озабоченность: Что, если нам не хватиит вакцин?<a href="#fn39" class="footnote-ref" id="fnref39" role="doc-noteref"><sup>39</sup></a> Что если мы поспешим, создав небезопасную вакцину?</p>
<p>Даже в кошмарном сне, когда вакцина отсутствует полностью, у нас есть 3 выхода. От наиболее ужасающих к более благоприятным:</p>
<p>1) Поддерживать количество больных на некотором уровне, чтобы достичь "естественного коллективного иммунитета". (Осторожно: может повлечь за собой много смертей и убитых лёгких. <em>И</em> не будет работать, если иммунитет недостаточно стойкий.)</p>
<p>2) Соблюдать снижающие R меры постоянно. Отслеживание контактов и ношение масок просто станет новой нормой в мире после COVID-19, так же как тесты на ЗППП и ношение презервативов стали новой нормой в мире после ВИЧ.</p>
@ -348,7 +350,7 @@
<div>Сейчас</div>
</div>
</div>
<p><a href="#fn38" class="footnote-ref" id="fnref38" role="doc-noteref"><sup>38</sup></a> Самолёт утонул. Мы перебрались на плоты. Нам нужно найти землю.<a href="#fn39" class="footnote-ref" id="fnref39" role="doc-noteref"><sup>39</sup></a></p>
<p><a href="#fn40" class="footnote-ref" id="fnref40" role="doc-noteref"><sup>40</sup></a> Самолёт утонул. Мы перебрались на плоты. Нам нужно найти землю.<a href="#fn41" class="footnote-ref" id="fnref41" role="doc-noteref"><sup>41</sup></a></p>
<p>Команды эпидемиологов и политиков (<a href="https://www.americanprogress.org/issues/healthcare/news/2020/04/03/482613/national-state-plan-end-coronavirus-crisis/">левых</a>, <a href="https://www.aei.org/research-products/report/national-coronavirus-response-a-road-map-to-reopening/">правых</a>, и <a href="https://ethics.harvard.edu/covid-roadmap">всех вместе</a>) пришли к консенсусу по вопросам борьбы с COVID-19, стараясь защитить наши жизни <em>и</em> свободы.</p>
<p>Вот основные идеи, и некоторые (менее консенсусные) запасные варианты:</p>
<p><img src="pics/plan.png" /></p>
@ -382,44 +384,46 @@
<p>Следовательно, 1 - ПредотвращённыеЗаражения &lt; 1/R<sub>0</sub></p>
<p>Следовательно, ПредотвращённыеЗаражения &gt; 1 - 1/R<sub>0</sub></p>
<p>Следовательно, достаточно остановить больше, чем <strong>1 - 1/R<sub>0</sub></strong> всех заражений, чтобы получить R &lt; 1 и сдержать распространение!<a href="#fnref12" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn13" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.statista.com/statistics/1105420/covid-icu-admission-rates-us-by-age-group/">"Percentage of COVID-19 cases in the United States from February 12 to March 16, 2020 that required intensive care unit (ICU) admission, by age group"</a>. От 4,9% до 11,5% <em>всех</em> случаев COVID-19 нуждались в реанимации. Оптимистично возьмём нижнюю оценку и получим 5% или 1 из 20. Отметим, что это число основано на возрастной пирамиде США, и будет выше в странах со старым населением и ниже в странах с молодым населением.<a href="#fnref13" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn13" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.statista.com/statistics/1105420/covid-icu-admission-rates-us-by-age-group/">"Percentage of COVID-19 cases in the United States from February 12 to March 16, 2020 that required intensive care unit (ICU) admission, by age group"</a>.<a href="#fnref13" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn14" role="doc-endnote"><p>"Число кроватей в отделениях интенсивной терапии = 96 596". Из <a href="https://sccm.org/Blog/March-2020/United-States-Resource-Availability-for-COVID-19">the Society of Critical Care Medicine</a> Население США составляло ~328 миллионов человек в 2019 году. 96 596 к 328 200 000 = около 1 к 3400.<a href="#fnref14" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn15" role="doc-endnote"><p>"Цель такая же, как у других стран: сгладить кривую, растягивая заражение на начальной стадии. Как следствие, у населения выработается коллективный иммунитет; Это побочный эффект, а не цель. [...] План действия правительства, доступный онлайн, вообще не упоминает коллективный иммунитет" (He says that the actual goal is the same as that of other countries: flatten the curve by staggering the onset of infections. As a consequence, the nation may achieve herd immunity; its a side effect, not an aim. [...] The governments actual coronavirus action plan, available online, doesnt mention herd immunity at all.)</p>
<p>Взято из <a href="https://www.theatlantic.com/health/archive/2020/03/coronavirus-pandemic-herd-immunity-uk-boris-johnson/608065/">атьи Эда Йонга в The Atlantic</a><a href="#fnref15" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn16" role="doc-endnote"><p>Это искажение ушло бы, если бы мы изображали R на логарифмической шкале, но тогда нам пришлось бы объяснять <em>логарифмическую шкалу.</em><a href="#fnref16" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn17" role="doc-endnote"><p>"В отсутствие других воздействий, главная метрика успеха социального дистанцирования — это заполненность реанимационных отделений. Чтобы её избежать, постоянный или прерывистый карантин может быть необходим до 2022 года." (Absent other interventions, a key metric for the success of social distancing is whether critical care capacities are exceeded. To avoid this, prolonged or intermittent social distancing may be necessary into 2022.) <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793">Kissler and Tedijanto et al</a><a href="#fnref17" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn18" role="doc-endnote"><p>Смотри <a href="https://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/1745691614568352">Рисунок 6 из работы Holt-Lunstad &amp; Smith 2010</a>. На самом деле, они нашли <em>корреляцию</em> в существующих выборках. Но было бы жестоко проводить рандомизированный контролируемый эксперимент, заставляя людей быть одинокими всю жизнь.<a href="#fnref18" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn19" role="doc-endnote"><p><strong>В среднем 3 дня до заразности:</strong> "Assuming an incubation period distribution of mean 5.2 days from a separate study of early COVID-19 cases, we inferred that infectiousness started from 2.3 days (95% CI, 0.83.0 days) before symptom onset" (перевод: Симптомы начинаются на пятый день, а заразным человек становится за 2 дня до этого = заразным человек становится на третий день) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al.</a></p>
<li id="fn16" role="doc-endnote"><p>"Все 8 доступных исследований сообщают, что мытьё рук снижает риск респираторных инфекций, но оценивают уменьшение риска по-разному, от 6 до 44%. Усреднённое значение составляет 24%, 90-процентный доверительный интервал — 6-40%." (All eight eligible studies reported that handwashing lowered risks of respiratory infection, with risk reductions ranging from 6% to 44% [pooled value 24% (95% CI 640%)].)<a href="#fnref16" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn17" role="doc-endnote"><p>"Мы обнаружили уменьшение в среднем числе контактов на человека в 73%. Этого должно быть достаточно для уменьшения R<sub>0</sub> со значения 2,6 до карантина до 0,62 (0,37 — 0,89)." (We found a 73% reduction in the average daily number of contacts observed per participant. This would be sufficient to reduce R0 from a value from 2,6 before the lockdown to 0,62 (0,37 - 0,89) during the lockdown.) Для простоты мы округлили это число до 70%. <a href="https://cmmid.github.io/topics/covid19/comix-impact-of-physical-distance-measures-on-transmission-in-the-UK.html">Jarvis and Zandvoort et al</a><a href="#fnref17" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn18" role="doc-endnote"><p>Это искажение ушло бы, если бы мы изображали R на логарифмической шкале, но тогда нам пришлось бы объяснять <em>логарифмическую шкалу.</em><a href="#fnref18" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn19" role="doc-endnote"><p>"В отсутствие других воздействий, главная метрика успеха социального дистанцирования — это заполненность реанимационных отделений. Чтобы её избежать, постоянный или прерывистый карантин может быть необходим до 2022 года." (Absent other interventions, a key metric for the success of social distancing is whether critical care capacities are exceeded. To avoid this, prolonged or intermittent social distancing may be necessary into 2022.) <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793">Kissler and Tedijanto et al</a><a href="#fnref19" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn20" role="doc-endnote"><p>Смотри <a href="https://journals.sagepub.com/doi/abs/10.1177/1745691614568352">Рисунок 6 из работы Holt-Lunstad &amp; Smith 2010</a>. На самом деле, они нашли <em>корреляцию</em> в существующих выборках. Но было бы жестоко проводить рандомизированный контролируемый эксперимент, заставляя людей быть одинокими всю жизнь.<a href="#fnref20" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn21" role="doc-endnote"><p><strong>В среднем 3 дня до заразности:</strong> "Assuming an incubation period distribution of mean 5.2 days from a separate study of early COVID-19 cases, we inferred that infectiousness started from 2.3 days (95% CI, 0.83.0 days) before symptom onset" (перевод: Симптомы начинаются на пятый день, а заразным человек становится за 2 дня до этого = заразным человек становится на третий день) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al.</a></p>
<p><strong>В среднем 4 дня до заражения кого-нибудь ещё:</strong> "The mean [serial] interval was 3.96 days (95% CI 3.534.39 days)" <a href="https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/6/20-0357_article">Du Z, Xu X, Wu Y, Wang L, Cowling BJ, Ancel Meyers L</a></p>
<p><strong>В среднем 5 дней до первых симптомов:</strong> "The median incubation period was estimated to be 5.1 days (95% CI, 4.5 to 5.8 days)" <a href="https://annals.org/AIM/FULLARTICLE/2762808/INCUBATION-PERIOD-CORONAVIRUS-DISEASE-2019-COVID-19-FROM-PUBLICLY-REPORTED">Lauer SA, Grantz KH, Bi Q, et al</a><a href="#fnref19" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn20" role="doc-endnote"><p>"По нашим оценкам, 44% (при 95%-ом доверительном интервале 25-69%) заражений произошло во время предсимптоматической стадии." (We estimated that 44% (95% confidence interval, 2569%) of secondary cases were infected during the index cases presymptomatic stage) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al</a><a href="#fnref20" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn21" role="doc-endnote"><p>"Отслеживание контактов в Либерии оказалось ключевым методом и представляет собой один из крупнейших примеров отслеживания контактов во время эпидемии в истории." (Contact tracing was a critical intervention in Liberia and represented one of the largest contact tracing efforts during an epidemic in history.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6152989/">Swanson KC, Altare C, Wesseh CS, et al.</a><a href="#fnref21" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn22" role="doc-endnote"><p>"Контакты больного были отслежены с момента его попадания на рейс «Аэрофлота» из Дели до последних дней. Были поимённо установлены не только друзья и знакомые, с которыми он был в контакте, но и таможенники встречавшей его смены, таксист, который вёз его домой, участковый врач и работники поликлиники. Одного из знакомых Кокорекина, отправившегося в Париж, решили снять с рейса «Аэрофлота», когда самолёт был в воздухе. Самолёт развернули, а опасного пассажира и всех, кто был на борту, отправили в карантин." <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/Ликвидация_вспышки_оспы_в_Москве_1959—1960">Ликвидация вспышки оспы в Москве 1959—1960</a><a href="#fnref22" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn23" role="doc-endnote"><p><a href="https://github.com/TCNCoalition/TCN#tcn-protocol">Temporary Contact Numbers, безопасный децентрализованный протокол отслеживания контактов</a><a href="#fnref23" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn24" role="doc-endnote"><p><a href="https://pact.mit.edu/">PACT: Private Automated Contact Tracing</a><a href="#fnref24" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn25" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.apple.com/ca/newsroom/2020/04/apple-and-google-partner-on-covid-19-contact-tracing-technology/">Apple и Google объединились в вопросе отслеживания контактов ради борьбы с COVID-19</a>. Причём они не создают <em>свои</em> приложения, а просто создают системы, которые будут <em>поддерживать</em> эти приложения.<a href="#fnref25" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn26" role="doc-endnote"><p>Многие новостные репортажи — а если честно, и многие научные работы — не делают различия между "случаями, в которых не оказалось симптомов, когда мы их тестировали" (предсимптоматическими) и "случаями, в которых симтпомы <em>вообще</em> не проявились" (настоящие асимптоматические). Единственный способ их отличить — продолжать наблюдения за случаями дольше.</p>
<p><strong>В среднем 5 дней до первых симптомов:</strong> "The median incubation period was estimated to be 5.1 days (95% CI, 4.5 to 5.8 days)" <a href="https://annals.org/AIM/FULLARTICLE/2762808/INCUBATION-PERIOD-CORONAVIRUS-DISEASE-2019-COVID-19-FROM-PUBLICLY-REPORTED">Lauer SA, Grantz KH, Bi Q, et al</a><a href="#fnref21" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn22" role="doc-endnote"><p>"По нашим оценкам, 44% (при 95%-ом доверительном интервале 25-69%) заражений произошло во время предсимптоматической стадии." (We estimated that 44% (95% confidence interval, 2569%) of secondary cases were infected during the index cases presymptomatic stage) <a href="https://www.nature.com/articles/s41591-020-0869-5">He, X., Lau, E.H.Y., Wu, P. et al</a><a href="#fnref22" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn23" role="doc-endnote"><p>"Отслеживание контактов в Либерии оказалось ключевым методом и представляет собой один из крупнейших примеров отслеживания контактов во время эпидемии в истории." (Contact tracing was a critical intervention in Liberia and represented one of the largest contact tracing efforts during an epidemic in history.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6152989/">Swanson KC, Altare C, Wesseh CS, et al.</a><a href="#fnref23" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn24" role="doc-endnote"><p>"Контакты больного были отслежены с момента его попадания на рейс «Аэрофлота» из Дели до последних дней. Были поимённо установлены не только друзья и знакомые, с которыми он был в контакте, но и таможенники встречавшей его смены, таксист, который вёз его домой, участковый врач и работники поликлиники. Одного из знакомых Кокорекина, отправившегося в Париж, решили снять с рейса «Аэрофлота», когда самолёт был в воздухе. Самолёт развернули, а опасного пассажира и всех, кто был на борту, отправили в карантин." <a href="https://ru.wikipedia.org/wiki/Ликвидация_вспышки_оспы_в_Москве_1959—1960">Ликвидация вспышки оспы в Москве 1959—1960</a><a href="#fnref24" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn25" role="doc-endnote"><p><a href="https://github.com/TCNCoalition/TCN#tcn-protocol">Temporary Contact Numbers, безопасный децентрализованный протокол отслеживания контактов</a><a href="#fnref25" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn26" role="doc-endnote"><p><a href="https://pact.mit.edu/">PACT: Private Automated Contact Tracing</a><a href="#fnref26" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn27" role="doc-endnote"><p><a href="https://www.apple.com/ca/newsroom/2020/04/apple-and-google-partner-on-covid-19-contact-tracing-technology/">Apple и Google объединились в вопросе отслеживания контактов ради борьбы с COVID-19</a>. Причём они не создают <em>свои</em> приложения, а просто создают системы, которые будут <em>поддерживать</em> эти приложения.<a href="#fnref27" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn28" role="doc-endnote"><p>Многие новостные репортажи — а если честно, и многие научные работы — не делают различия между "случаями, в которых не оказалось симптомов, когда мы их тестировали" (предсимптоматическими) и "случаями, в которых симтпомы <em>вообще</em> не проявились" (настоящие асимптоматические). Единственный способ их отличить — продолжать наблюдения за случаями дольше.</p>
<p>Именно так и поступают <a href="https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/26/8/20-1274_article">в этом исследовании</a>. (Дисклеймер: статьи с ранним доступом могут отличаться от финальной версии) Во время вспышки COVID-19 в колл-центре в Южной Корее "только четверо (1,9%) так и остались асимптоматическими после 14 дней карантина, и никто их их домочадцев не пробрёл вторичной инфекции."</p>
<p>Итак, "настоящие асимптоматические" редки, а подхватить болезнь у асимптоматика — ещё большая редкость!<a href="#fnref26" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn27" role="doc-endnote"><p>Из того же Оксфордского исследования, которое порекомендовало использовать приложения для борьбы с COVID-19: <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936/tab-figures-data">Luca Ferretti &amp; Chris Wymant et al</a> См. рис. 2. В предположении, что R<sub>0</sub> = 2,0, они обнаружили, что:</p>
<p>Итак, "настоящие асимптоматические" редки, а подхватить болезнь у асимптоматика — ещё большая редкость!<a href="#fnref28" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn29" role="doc-endnote"><p>Из того же Оксфордского исследования, которое порекомендовало использовать приложения для борьбы с COVID-19: <a href="https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/09/science.abb6936/tab-figures-data">Luca Ferretti &amp; Chris Wymant et al</a> См. рис. 2. В предположении, что R<sub>0</sub> = 2,0, они обнаружили, что:</p>
<ul>
<li>Симптоматики дают вклад R = 0,8 (40%)</li>
<li>Предсимптоматики дают вклад R = 0,9 (45%)</li>
<li>Асимптоматики дают вклад R = 0,1 (5%, хотя их модель включает в себя неопределённость и это число может быть куда меньше)</li>
<li>Заражение из окружающей среды вроде дверных ручек дают вклад R = 0,2 (10%)</li>
</ul>
<p>Если сложить пред- и асимптоматические контакты (45% + 5%), получится 50% от R!<a href="#fnref27" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn28" role="doc-endnote"><p>"Никакая из представляенных хирургических масок не фильтрует и не прилегает к лицу достаточно хорошо, чтобы считаться средством респираторной защиты" (None of these surgical masks exhibited adequate filter performance and facial fit characteristics to be considered respiratory protection devices.) <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0196655307007742">Tara Oberg &amp; Lisa M. Brosseau</a><a href="#fnref28" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn29" role="doc-endnote"><p>"Сокращение на 70% числа копий в аэрозоле, которое мы увидели, вкупе с почти полным исчезновением крупных капель, продемострированным в статье Джонсона, Дрюса, Бёрча и Грейсона, позволяет предположить, что хирургические маски, надетые на инфицированного человека, могут оказывать клинически значимый эффект на передачу заболевания." (The overall 3.4 fold reduction [70% reduction] in aerosol copy numbers we observed combined with a nearly complete elimination of large droplet spray demonstrated by Johnson et al. suggests that surgical masks worn by infected persons could have a clinically significant impact on transmission.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3591312/">Milton DK, Fabian MP, Cowling BJ, Grantham ML, McDevitt JJ</a><a href="#fnref29" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn30" role="doc-endnote"><p>Любой учёный, кто читает последнее предложение, вероятно смеётся сквозь слёзы прямо сейчас. Смотри <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Data_dredging">p-hacking</a> <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Replication_crisis">the replication crisis</a>)<a href="#fnref30" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn31" role="doc-endnote"><p><strong>"Мы должны сохранить резервные запасы для больниц!"</strong> <em>"Полностью согласны",</em> но это скорее спор по поводу увеличения производства масок, не об их рачительном испольовании. Пока суть да дело, можно делать маски из ткани.<a href="#fnref31" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn32" role="doc-endnote"><p>"Повышение температуры на один градус по Цельсию [...] понижает R на 0,0225" и "Среднее значение R в этих 100 городах составляет 1,83" 0,0225 ÷ 1,83 = ~1,2%. <a href="https://papers.ssrn.com/sol3/Papers.cfm?abstract_id=3551767">Wang, Jingyuan and Tang, Ke and Feng, Kai and Lv, Weifeng</a><a href="#fnref32" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn33" role="doc-endnote"><p>"SARS-специфические антитела поддерживались на протяжении 2 лет [...] Значит, SARS пациенты могут заразиться повторно после 3 лет после начального заражения." (SARS-specific antibodies were maintained for an average of 2 years [...] Thus, SARS patients might be susceptible to reinfection ≥3 years after initial exposure.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851497/">Wu LP, Wang NC, Chang YH, et al.</a>. "К сожалению", мы никогда не узнаем сколько продлился бы иммунитет от SARS, поскольку мы довольно быстро искоренили его.<a href="#fnref33" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn34" role="doc-endnote"><p>"Мы не обнаружили существенной разницы между вероятностью срабатывания теста хотя бы однажды и вероятность возвращения для бета-коронавирусов HKU1 и OC43 на 34 неделе после первого заражения." (We found no significant difference between the probability of testing positive at least once and the probability of a recurrence for the beta-coronaviruses HKU1 and OC43 at 34 weeks after enrollment/first infection.) <a href="http://www.columbia.edu/~jls106/galanti_shaman_ms_supp.pdf">Marta Galanti &amp; Jeffrey Shaman (PDF)</a><a href="#fnref34" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn35" role="doc-endnote"><p>"Пока человек только поборол вирус, его частицы могут оставаться в организме. Они не могут привести к инфекции, но могут вызвать срабатывание теста." (Once a person fights off a virus, viral particles tend to linger for some time. These cannot cause infections, but they can trigger a positive test.) <a href="https://www.statnews.com/2020/04/20/everything-we-know-about-coronavirus-immunity-and-antibodies-and-plenty-we-still-dont/">from STAT News by Andrew Joseph</a><a href="#fnref35" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn36" role="doc-endnote"><p>Из <a href="https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990226v1.abstract">Bao et al.</a> <em>Дисклеймер: Эта статья является препринтом и не была подвержена рецензированию.</em> Мы обращаем ваше внимание, что они проверяли повторное заражение только через 28 дней.<a href="#fnref36" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn37" role="doc-endnote"><p>"Когда изобретут вакцину от коронавируса, сможем ли мы произвести её в достаточном количестве?" (If a coronavirus vaccine arrives, can the world make enough?) <a href="https://www.nature.com/articles/d41586-020-01063-8">by Roxanne Khamsi, on Nature</a><a href="#fnref37" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn38" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref38" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn39" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref39" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<p>Если сложить пред- и асимптоматические контакты (45% + 5%), получится 50% от R!<a href="#fnref29" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn30" role="doc-endnote"><p>"Никакая из представляенных хирургических масок не фильтрует и не прилегает к лицу достаточно хорошо, чтобы считаться средством респираторной защиты" (None of these surgical masks exhibited adequate filter performance and facial fit characteristics to be considered respiratory protection devices.) <a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0196655307007742">Tara Oberg &amp; Lisa M. Brosseau</a><a href="#fnref30" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn31" role="doc-endnote"><p>"Сокращение на 70% числа копий в аэрозоле, которое мы увидели, вкупе с почти полным исчезновением крупных капель, продемострированным в статье Джонсона, Дрюса, Бёрча и Грейсона, позволяет предположить, что хирургические маски, надетые на инфицированного человека, могут оказывать клинически значимый эффект на передачу заболевания." (The overall 3.4 fold reduction [70% reduction] in aerosol copy numbers we observed combined with a nearly complete elimination of large droplet spray demonstrated by Johnson et al. suggests that surgical masks worn by infected persons could have a clinically significant impact on transmission.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3591312/">Milton DK, Fabian MP, Cowling BJ, Grantham ML, McDevitt JJ</a><a href="#fnref31" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn32" role="doc-endnote"><p>Любой учёный, кто читает последнее предложение, вероятно смеётся сквозь слёзы прямо сейчас. Смотри <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Data_dredging">p-hacking</a> <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Replication_crisis">the replication crisis</a>)<a href="#fnref32" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn33" role="doc-endnote"><p><strong>"Мы должны сохранить резервные запасы для больниц!"</strong> <em>"Полностью согласны",</em> но это скорее спор по поводу увеличения производства масок, не об их рачительном испольовании. Пока суть да дело, можно делать маски из ткани.<a href="#fnref33" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn34" role="doc-endnote"><p>"Повышение температуры на один градус по Цельсию [...] понижает R на 0,0225" и "Среднее значение R в этих 100 городах составляет 1,83" 0,0225 ÷ 1,83 = ~1,2%. <a href="https://papers.ssrn.com/sol3/Papers.cfm?abstract_id=3551767">Wang, Jingyuan and Tang, Ke and Feng, Kai and Lv, Weifeng</a><a href="#fnref34" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn35" role="doc-endnote"><p>"SARS-специфические антитела поддерживались на протяжении 2 лет [...] Значит, SARS пациенты могут заразиться повторно после 3 лет после начального заражения." (SARS-specific antibodies were maintained for an average of 2 years [...] Thus, SARS patients might be susceptible to reinfection ≥3 years after initial exposure.) <a href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851497/">Wu LP, Wang NC, Chang YH, et al.</a>. "К сожалению", мы никогда не узнаем сколько продлился бы иммунитет от SARS, поскольку мы довольно быстро искоренили его.<a href="#fnref35" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn36" role="doc-endnote"><p>"Мы не обнаружили существенной разницы между вероятностью срабатывания теста хотя бы однажды и вероятность возвращения для бета-коронавирусов HKU1 и OC43 на 34 неделе после первого заражения." (We found no significant difference between the probability of testing positive at least once and the probability of a recurrence for the beta-coronaviruses HKU1 and OC43 at 34 weeks after enrollment/first infection.) <a href="http://www.columbia.edu/~jls106/galanti_shaman_ms_supp.pdf">Marta Galanti &amp; Jeffrey Shaman (PDF)</a><a href="#fnref36" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn37" role="doc-endnote"><p>"Пока человек только поборол вирус, его частицы могут оставаться в организме. Они не могут привести к инфекции, но могут вызвать срабатывание теста." (Once a person fights off a virus, viral particles tend to linger for some time. These cannot cause infections, but they can trigger a positive test.) <a href="https://www.statnews.com/2020/04/20/everything-we-know-about-coronavirus-immunity-and-antibodies-and-plenty-we-still-dont/">from STAT News by Andrew Joseph</a><a href="#fnref37" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn38" role="doc-endnote"><p>Из <a href="https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.03.13.990226v1.abstract">Bao et al.</a> <em>Дисклеймер: Эта статья является препринтом и не была подвержена рецензированию.</em> Мы обращаем ваше внимание, что они проверяли повторное заражение только через 28 дней.<a href="#fnref38" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn39" role="doc-endnote"><p>"Когда изобретут вакцину от коронавируса, сможем ли мы произвести её в достаточном количестве?" (If a coronavirus vaccine arrives, can the world make enough?) <a href="https://www.nature.com/articles/d41586-020-01063-8">by Roxanne Khamsi, on Nature</a><a href="#fnref39" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn40" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref40" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
<li id="fn41" role="doc-endnote"><p>Метафора с поиском земли <a href="https://www.statnews.com/2020/04/01/navigating-covid-19-pandemic/">Marc Lipsitch &amp; Yonatan Grad, на STAT News</a><a href="#fnref41" class="footnote-back" role="doc-backlink">↩︎</a></p></li>
</ol>
</section>

View File

@ -254,6 +254,7 @@ R < 1.
Около 1 из 20 людей заражённых COVID-19 нуждаются в реанимации.[^icu_covid] В богатых странах вроде США одна кровать в реанимационном отделении приходится на 3400 людей.[^icu_us] Следовательно, США могут выдержать 20 больных на 3400 людей *одновременно* — другими словами около 0,6% населения.
[^icu_covid]: ["Percentage of COVID-19 cases in the United States from February 12 to March 16, 2020 that required intensive care unit (ICU) admission, by age group"](https://www.statista.com/statistics/1105420/covid-icu-admission-rates-us-by-age-group/).
От 4,9% до 11,5% *всех* случаев COVID-19 нуждались в реанимации. Оптимистично возьмём нижнюю оценку и получим 5% или 1 из 20. Отметим, что это число основано на возрастной пирамиде США, и будет выше в странах со старым населением и ниже в странах с молодым населением.
[^icu_us]: "Число кроватей в отделениях интенсивной терапии = 96 596". Из [the Society of Critical Care Medicine](https://sccm.org/Blog/March-2020/United-States-Resource-Availability-for-COVID-19) Население США составляло \~328 миллионов человек в 2019 году. 96 596 к 328 200 000 = около 1 к 3400.
@ -287,8 +288,11 @@ R < 1.
Давайте вначале посмотрим на два главных способа "сгладить кривую": мытьё рук и соблюдение дистанции.
Частое мытьё рук снижает гриппы и простуды на \~25%[^handwashing], а введение жёсткого карантина в Лондоне сократило количество близких контактов на 70%[^london]. Давайте предположим, что мытьё рук уменьшает R на 25% *или меньше*, а дистанцирование на 70% *или меньше*:
[^handwashing]: "Все 8 доступных исследований сообщают, что мытьё рук снижает риск респираторных инфекций, но оценивают уменьшение риска по-разному, от 6 до 44%. Усреднённое значение составляет 24%, 90-процентный доверительный интервал — 6-40%." (All eight eligible studies reported that handwashing lowered risks of respiratory infection, with risk reductions ranging from 6% to 44% [pooled value 24% (95% CI 640%)].)
Мы округлили усреднённое значение до 25% для простоты. [Rabie, T. и Curtis, V.](https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/j.1365-3156.2006.01568.x) Обратите внимание, в этом метаанализе указывают на ужасное качество исследований мытья рук.
[^london]: "Мы обнаружили уменьшение в среднем числе контактов на человека в 73%. Этого должно быть достаточно для уменьшения R<sub>0</sub> со значения 2,6 до карантина до 0,62 (0,37 — 0,89)." (We found a 73% reduction in the average daily number of contacts observed per participant. This would be sufficient to reduce R0 from a value from 2,6 before the lockdown to 0,62 (0,37 - 0,89) during the lockdown.) Для простоты мы округлили это число до 70%. [Jarvis and Zandvoort et al](https://cmmid.github.io/topics/covid19/comix-impact-of-physical-distance-measures-on-transmission-in-the-UK.html)
**Поиграйте с этим калькулятором, чтобы увидеть как % не-<icon s></icon>, мытьё рук и дистанцирование уменьшают R:** (этот калькулятор визуализирует *относительные* эффекты, поэтому кажется, что увеличение некоторых эффектов выглядит как уменьшение других).[^log_caveat])
@ -698,6 +702,7 @@ R = 1, **стабильность.**
<div>Сейчас</div>
</div>
</div>
[^dry_land]
Самолёт утонул. Мы перебрались на плоты. Нам нужно найти землю.[^dry_land]